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Participez à Folding@home

Le projet Folding@home
Folding@home est un projet scientifique de calcul distribué à caractère biomédical, dont le but est d'étudier le processus de repliement des protéines en vue d'établir leur conformation finale.

Pourquoi le "folding" (processus de repliement) est-il si important ?

« En tant qu'éléments structurels, les protéines sont le composant principal de nos os, de nos muscles, de nos cheveux, de notre peau et de nos vaisseaux sanguins. En tant qu'anticorps, elles reconnaissent les éléments intrus et permettent au système immunitaire de se débarrasser des indésirables. » (Source : Folding@home, Université Stanford en Californie, USA).
Un dysfonctionnement dans leur repliement amène à ce qui n'a pas lieu d'être, c'est-à-dire à des anomalies, causes essentielles des maladies dramatiques que sont les maladies du cancer, d'Alzheimer, de Creutzfeldt-Jakob, de Parkinson... Et nous savons que ces maladies touchent de plus en plus de personnes. Il est donc devenu vital de résoudre rapidement le mystère du repliement des protéines, grâce à une cartographie extrêmement précise.

Vous voulez en savoir plus sur le rôle capital que jouent les protéines dans nos organismes, l'objectif et les enjeux du projet Folding@home ?
Visitez le site officiel, ainsi que celui de l'Alliance Francophone dont notre équipe fait partie.
De par sa vocation universelle, humanitaire et altruiste (les résultats bruts des simulations sont mis gratuitement à disposition des chercheurs), le projet Folding@home connaît un immense succès. À un tel point que l'extraordinaire réussite de son portage sur la Playstation 3 de Sony l'a fait entrer dans le livre Guiness des records, en tant que réseau de calcul distribué le plus puissant de la planète.

Nous y sommes... "Distributed computing" (calcul distribué) : kézako ?

Cela consiste tout simplement au découpage d'un calcul extrêmement complexe et long en des milliers d'unités et de sous-unités plus petites, dont le traitement est confié à une multitude d'ordinateurs. Et là où cette technologie excelle, c'est qu'elle puise uniquement la puissance de calcul inutilisée des ordinateurs. L'utilisateur aura toujours la main car le logiciel client installé sur sa machine travaille en priorité basse. Et c'est ainsi que, dans ses travaux de tous les jours ou même avec des applications très gourmandes sur les machines plus modernes, il ne se rendra pratiquement pas compte du calcul effectué en arrière-plan, tout simplement parce que le traitement se mettra de façon dynamique au diapason des ressources restantes de l'ordinateur.

Folding@home utilise donc la puissance disponible des ordinateurs sur lesquels ses logiciels clients ont été installés. Il prendra 100 % des ressources pendant que l'utilisateur ne se sert pas de son ordinateur, et, cas extrême, pratiquement 0 % si l'ordinateur est énormément sollicité.


L'équipe Zebulon.fr
Afin d'attirer et de fidéliser les participants, le staff de Folding@home a mis en place un système de rétribution : chaque unité de travail rendue rapporte un certain nombre de points au contributeur. Et pour susciter et entretenir l'esprit de compétition, un classement est établi. Le classement est individuel mais il est également tenu à jour par équipes, elles-mêmes pouvant regrouper plusieurs mini-équipes.

Notre site informatique Zebulon.fr a sa propre mini-équipe. Tous ses membres se reconnaissent à leur pseudo commençant par [Zebulon.fr]_ et à sa bannière ou ses diverses déclinaisons qu'ils peuvent arborer s'ils le souhaitent (voir ici) :



Notre mini-équipe fait partie de l'équipe 51 qui est celle de l'Alliance Francophone. Il est important de respecter les règles suivantes lors de la configuration du logiciel client que nous découvrirons plus loin :
Pseudo : [Zebulon.fr]_pseudo
Numéro d'équipe : 51

Cependant, si suivre l'évolution de son classement est motivant en soi, le but premier du contributeur est d'apporter son aide aux chercheurs soucieux de faire avancer la recherche médicale. C'est pourquoi toute contribution est utile, même la plus petite. Comme on dit : « les petits ruisseaux font les grandes rivières ».

N'hésitez pas à rejoindre notre discussion sur le topic unique !


Recommandations concernant le choix et l'installation du client Folding@home
Vous avez décidé d'apporter votre pierre à ce noble édifice qu'est le projet Folding@home et vous vous demandez par où commencer ?
C'est très simple, il suffit de télécharger et d'installer sur votre ordinateur un logiciel client fourni par Folding@home. Une fois configuré, ce logiciel récupèrera automatiquement, via Internet, sur les serveurs de l'Université Stanford, une unité de travail brute. Votre ordinateur la traitera puis, une fois le calcul achevé, la rendra aux serveurs, déclenchant le téléchargement d'une nouvelle unité à traiter. Etc...

Les clients Folding@home ne sont disponibles que sur les pages "Download" du site officiel, qui fournissent les clients classés par système d'exploitation et type de machine.

Quel client choisir ?
Cela dépend donc de la machine sur laquelle vous allez plier et de son système d'exploitation, et voici le complément d'information nécessaire pour bien choisir votre client et bien débuter.
Clients pour CPU
- processeur mono-core sous Windows 32/64 bits NT/2000 : client 5.04 text-only console
- processeur mono-core sous Windows 32/64 bits XP/2003/Vista : client 6.23 console client only
- processeur multi-core sous Windows 32/64 bits XP/2003/2008/Vista/7 : client SMP2 6.30
- processeur mono-core sous Linux 32 bits : client 6.02 Linux
- processeur mono-core ou multi-core sous Linux 64 bits : client 6.29 beta Linux
Clients pour GPU
Cartes graphiques ATI des séries 2xxx, 3xxx, 4xxx et cartes graphiques NVidia à partir de la série 8
- carte graphique sous Windows XP/2003 : client 6.23 Windows XP/2003 GPU console
- carte graphique sous Windows Vista : client 6.23 Windows Vista GPU console
Client pour la PlayStation 3 de Sony
- PS3 : client PS3 natif


Tutoriels et articles
Tutos pour clients CPU classiques Windows
- tuto pour le client 5.04 text-only console pour CPU sous Windows NT/2000/XP/Vista (lancement d'une ou deux consoles)
- tuto pour le client 6.23 console client only pour CPU sous Windows XP/2003/Vista
- tuto pour le client 6.23 System tray pour CPU sous Windows XP/2003/Vista
Tuto pour client CPU SMP Windows
- tuto pour le client SMP2 6.30 pour CPU sous Windows 32/64 bits XP/2003/2008/Vista/7
Tutos pour clients GPU Windows
- tuto pour le client 6.23 GPU console (cartes graphiques ATI et NVidia) pour GPU sous Windows XP/2003/Vista
- tuto pour le client 6.23 GPU System tray (installer msi - cartes graphiques ATI et NVidia) pour GPU sous Windows XP/2003/Vista
Tutos pour clients CPU Linux
- tuto pour le client 6.02 Linux (unifié : uniprocesseur et SMP) pour CPU sous Linux 32/64 bits
- tuto pour le client 6.29 beta Linux (unifié : uniprocesseur et SMP) pour CPU sous Linux 64 bits
Tuto pour PS3
- tuto pour le client PS3 pour PlayStation 3 de Sony

Tutos divers
- Participer au monito avec FahMon
- Participer au monito avec HFM.net
- tuto FahMon pour Windows : pour suivre l'avancement des calculs, connaître la date de fin estimée, le nombre de points apportés et bien d'autres infos.
- tuto FahMon pour Linux
- tuto HFM.net pour Windows : plus performant que FahMon et son créateur le maintient à jour.
- les paramètres : signification - placement - conditions d'utilisation
- tuto pour la carte de bouclage Microsoft : simule une connexion réseau permanente et empêche les clients SMP d'arrêter le calcul en cas d'une déconnexion réseau réelle.
Articles
- article sur la structure des protéines : pour en apprendre davantage sur les protéines.
Liens externes
- le Site du Zéro : explications et tutos régulièrement mis à jour.


Classement des participants
- le projet Folding@home : classement mondial sur le site officiel, statistiques sur KakaoStats
- l'équipe de l'Alliance Francophone : classement des mini-teams et des membres, top 20 des producteurs
- la mini-team Zebulon.fr : liste et classement des membres actifs.



À bientôt ?
l'équipe de Folding@home de Zebulon.fr

Ce message a été modifié par Cobra - 16 septembre 2010 - 10:07 .

salut TheClem,

je suis dans la liste, mais bon, opérationnel dans 3 ans

Salut TheClem , frerot, je suis en deux fois, je me suis planté en configurant le client linux, j'ai mis un _ devant, si JWhy peut détruire ce compte

Bah ça donne l'impression d'avoir un membre en plus
http://forum.presence-pc.com/foldinghome/F...sujet-365-1.htm

Mince on a perdu notre petite discution avec les membres de 3dchips-fr du coup

Heureux de vous revoir les amis et bravo encore à Yann pour la remise en route du forum

Sinon, notre petite épopée dans le cadre du projet folding semble pas mal se débrouiller. D'après ce que j'ai pu voir 3 zébuliens dans les 90 000 premiers
Ca bosse dur chez Zeb

Mais c'est pas encore gagné alors rameuter vos copains, on le va restructurer le Génome


++

[edit] heu au fait je suis inscrit depuis le 25/05 alors m'oublier passsssssssssssssss
[Zebulon.fr]_Kane179, et donc au moins 13 membres [/edit]

Ce message a été modifié par kane179 - 03 juin 2004 - 04:58 .

Salut
il y a Greywolf aussi d'inscrit sous le nom [Zebulon.fr]_Greywolf.

@+
Davy, qui n'est plus le créateur du topic

Euh au fait , pourquoi JWhy est l'admin de notre mini-team

j'ai rien contre ce "brave garcon" mais trouve bizarre que personne de chez nous le soit.

Laubean l'avait soit-disant fait

13 membres ... avec [zebulon.fr]_tbb !

Salut tous !

Content de me retrouver ici

Topic intéressant si quelqu'un a des petits problèmes ... comme moi :

http://forum.presence-pc.com/foldinghome/F...sujet-514-1.htm

Hum, quitte à passer pour un boulet qui n'a pas suivi, je pose ma question. C'est quoi Folding@home exactement ??
Tout le monde en parle, mais personne ne dit exactmeent ce que ça fait....