Hello,
Il est possible qu'il y ait des caractères cachés dans le nom des répertoires créés en double (espaces invisibles par exemple), ce qui expliquerait que le nom ne soit pas incrémenté avec un numéro (les noms de répertoires étant différents même si tu ne le vois pas).
Je crois que pour l'instant, la seule option qu'il te reste est la tentative d'effacement manuel...
Pour gagner du temps, tu peux peut-être essayer Total Commander :
http://www.ghisler.com/accueil.htm
gratuit en version d'essai (tu as juste à cliquer sur un bouton au démarrage).
Après l'installation, tu appuis avec la barre espace sur le nom d'un répertoire suspect et il t'indiquera sa taille, qui devrait être de zéro octets. Si c'est le cas, tu sélectionnes avec le bouton de la souris et tu supprimes.
Au niveau de la navigation, toutes les manips devraient être plus rapides avec Total Commander qu'avec l'explorateur de Windows en tout cas.
Tiens-nous au courant, et vérifie si les premiers répertoires suspects que tu effaces ne sont pas regénérés après le premier reboot, ça t'évitera peut-être de perdre du temps si tu es confrontée à un malware qui pourrait nécessiter une réinstallation...