Ce topic m'a aidé a voir plus clair dans mon problème de doublons. La solution de faire disparaitre les doublons automatiquement n'étant pas tout à fait satisfaisante, j'ai une solution pour mon problème particulier qui n'est pas forcement une solution générique mais je la note au cas où cela servirait à quelqu'un:
J'ai constaté que mon popstate.dat ne changeait pas de date: en fait tout mon dossier de mail avait l'attribut caché. J'ai donc sélectionner le dossier dans l'explorer. clic droit. Propriétés. J'ai décoché lecture seule (qui était un attribut juste du dossier du haut pas des sous dossiers) et j'ai surtout décoché caché. Ensuite, j'ai fait appliquer et à la question "appliquer les modi..." J'ai répondu: modifier tout (appliquer aux sous dossier et fichiers).
Et là bingo, je n'ai plus de problème mon popstate se met à jour et je ne charge donc plus de messages qui ne sont pas nouveaux.