Je reprends ce post un peu ancien, car j'ai rencontré le même pb pour importer dans IE8 mes marque-pages Firefox.
J'y suis finalement arrivé en prenant les précautions suivantes :
-vidage préalable du dossier Favoris dans IE (en copiant dans un autre répertoire les favoris installés)
-répartition de l'ensemble des marques-pages dans plusieurs fichiers bookmark.html, car je me suis rendu compte que mon fichier total initial ne se retrouvait que partiellement dans IE
-contrôle du contenu des fichiers bookmark.html en les important préalablement dans Firefox ouvert avec un nouveau profil
-copie des fichiers bookmark dans le répertoire par défaut proposé dans IE (C:\Documents and Settings\Nom\Mes documents\)
Avec tout ça, ce qui fait quand même pas mal, j'ai pu retrouver tous mes marque-pages dans IE. Il est quand même évident que la procédure d'import ne peut avaler n'importe quelle taille de fichier, il faut donc être raisonnable et ne pas lui proposer des fichiers trop gros. Mon fichier initial faisait 1,32 MO, j'en ai fait 3 fichiers de 400/500 Ko.
Voilà, j'espère que ces conseils aideront.