Folding : le topic

[Micky_mike]

Salut à tous,

 

Cobra et les piplettes: continuez de poster c'est un plaisir de vous lire!!!

 

Sinon, en temps que bon dernier je demande de l'aide: j'ai un problème qui vient de se répéter et je ne parviens pas à finir ma WU. Celle-ci recommence à 0 à chaque fois. Voici le log:

 

[06:03:46] Loaded queue successfully.

[06:03:46] + Benchmarking ...

[06:03:50]

[06:03:50] + Processing work unit

[06:03:50] Core required: FahCore_81.exe

[06:03:50] Core found.

[06:03:50] Working on Unit 01 [January 26 06:03:50]

[06:03:50] + Working ...

[06:03:50]

[06:03:50] *------------------------------*

[06:03:50] Folding@Home Gromacs Simulated Tempering Core

[06:03:50] Version 1.10 (Oct 4, 2007)

[06:03:50]

[06:03:50] Preparing to commence simulation

[06:03:50] - Looking at optimizations...

[06:03:50] - Files status OK

[06:03:51] - Expanded 364998 -> 1799396 (decompressed 492.9 percent)

[06:03:52]

[06:03:52] Project: 3737 (Run 68, Clone 11, Gen 5)

[06:03:52]

[06:03:52] Assembly optimizations on if available.

[06:03:52] Entering M.D.

[06:04:13] (Starting from checkpoint)

[06:04:13] Protein: p3737_Seq20_Amber03_Native

[06:04:13]

[06:04:13] Writing local files

[06:04:55] Completed 675000 out of 1500000 steps (45)

[06:04:55] Extra SSE boost OK.

[06:39:44] Writing local files

[06:39:44] Completed 690000 out of 1500000 steps (46)

[06:51:34] Size of work/wudata_01.xtc not what saved.

[06:51:34]

[06:51:34] Folding@home Core Shutdown: FILE_IO_ERROR

[06:51:36] CoreStatus = 75 (117)

[06:51:36] Error opening or reading from a file.

[06:51:36] Deleting current work unit & continuing...

[06:51:40] - Preparing to get new work unit...

[06:51:40] + Attempting to get work packet

[06:51:40] - Connecting to assignment server

[06:51:42] - Successful: assigned to (171.64.122.82).

[06:51:42] + News From Folding@Home: Welcome to Folding@Home

[06:51:42] Loaded queue successfully.

[06:51:49] + Closed connections

[06:51:54]

[06:51:54] + Processing work unit

[06:51:54] Core required: FahCore_81.exe

[06:51:54] Core found.

[06:51:54] Working on Unit 02 [January 26 06:51:54]

[06:51:54] + Working ...

[06:51:54]

[06:51:54] *------------------------------*

[06:51:54] Folding@Home Gromacs Simulated Tempering Core

[06:51:54] Version 1.10 (Oct 4, 2007)

[06:51:54]

[06:51:54] Preparing to commence simulation

[06:51:54] - Looking at optimizations...

[06:51:54] - Created dyn

[06:51:54] - Files status OK

[06:51:55] - Expanded 364997 -> 1799396 (decompressed 492.9 percent)

[06:51:55] - Starting from initial work packet

[06:51:55]

[06:51:55] Project: 3737 (Run 68, Clone 11, Gen 5)

[06:51:55]

[06:51:55] Assembly optimizations on if available.

[06:51:55] Entering M.D.

[06:52:01] Protein: p3737_Seq20_Amber03_Native

[06:52:01]

[06:52:01] Writing local files

[06:52:45] Extra SSE boost OK.

[06:52:45] Writing local files

[06:52:45] Completed 0 out of 1500000 steps (0)

 

L'autre jour j'ai marqué 30 pts quand même. Disons que ce qui m'embête le plus c'est de ne pas finir la WU; du coup j'suis encore moins utile que d'habitude. A cette vitesse là je vais pas tarder de reculer...

 

Avez-vous une idée?

 

Merci à tous

[BOBPILOU]

Bonjour Micky_mike!

 

Moi, à ta place, je virerai cette wu! J'ai déjà eu ce genre de problème de redépart à zéro. Tout ce que j'ai trouvé c'est de tout recommencer....

Si je ne dis pas d'erreur, tu supprimes le dossier "work" et le fichier queue.dat. Là tu relances ton client qui, ne trouvant pas de travail, va en recharger un autre......

 

Par contre, je vois dans ton log que c'est la wu n°01? Tu as pourtant déjà calculé des wus.....C'est un nouvel ordi ? Ou alors, t'as déjà viré le programme pour tout réinstaller?

 

 

Cobra : arrête de bouder et viens nous aider!

[Cobra]

Je ne boude pas, je fais ma tête de cochon

 

Bon, c'est fini, je termine un truc et je reviens vous embêter

 

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Moi, je calcule des protéines...

Fondamental pour la recherche médicale... Cancer - Parkinson - Alzheimer - Creutzfeld Jakob...

Folding@Home : http://forum.zebulon.fr/index.php?showtopic=44617

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[BOBPILOU]

Coooooool!

[Micky_mike]

Ah ben pourtant c'est mon PC de départ et je n'ai jamais réinstallé le client

 

 

J'fais quoi chef?

[BOBPILOU]

c'est bizarre ça........t'en penses quoi Cobra?

 

Il n'aurait pas intérêt à tout réinstaller?

[Cobra]

Bon, j'arrête de faire ma tête de cochon

 

Je vous remercie tous pour vos signes de sympathie et votre confiance... depuis des mois que je gardais ça, mon moral descendait de plus en plus et était presqu'arrivé à mes chaussettes et j'avais un grand besoin d'être rassuré de ne pas en faire trop. C'est peut-être aussi dû à un peu de fatigue (ne plus savoir quel jour on est m'arrive un peu trop souvent ) Sans doute je fais trop de chose en même temps, Faudra que je fasse des coupes franches, mais ce ne sera pas aux dépends de notre folding.

 

TheClem, c'est sûr que si on ne pratique pas les divers clients folding, c'est pas évident de bien les appréhender et surtout de faire des tutos. Si tu as besoin d'infos sur ces clients ou des tutos simples comme j'ai l'habitude de mettre sur le forum, tu n'hésites pas. Mais tu es un gars intelligent, je sais que tu sauras bien te débrouiller

 

Je lève mon verre à l'amitié...

 

 

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[Cobra]

Pour Niko et Micky, il me semble que vous avez tous les deux des T5500 sous Vista ? Si ça se trouve ça n'aime pas folding

 

Blague mise à part, il ne faut pas oublier de travailler sous le compte administrateur, installer folding dans le répertoire racine.

 

Niko, par expérience, je sais que les optimisations SSE sont toujours activés pour le client SMP, que le client sort d'un plantage ou pas, le paramètre pour forcer les optimisations ne sert donc à rien contrairement au client classique 5.04.

 

Tu dis que le client s'arrête de calculer... Si dans la fenêtre, le petit curseur continue à clignoter et il n'est pas fait mention d'une erreur comme si tout marche alors que le traitement est arrêté (ça n'avance plus et en regardant dans le Gestionnaire des tâches, les processus sont arrêtés), c'est tout simplement qu'il y a eu une déconnection réseau ou internet. Et en effet, en relançant la console, ça repart bien au checkpoint...

 

Quant au ralentissement dont tu parles, si c'est de l'ordre d'environ 10 %, ça peut être normal. D'une WU (même projet) à l'autre, il peut y avoir un écart, et il peut même y avoir une fluctuation en cours de traitement de la même WU. Sauf si la température atteint un tel niveau que le throttle régule la vitesse du processeur. La température est donc à vérifier (sur mon T5600, j'ai 72-75° sans problème).

 

Micky, commence par réinstaller folding comme t'a dit TitiGrosminet. Et selon les particularités de Vista (Vista pouaaaaah ) comme j'ai dit plus haut.

Sinon, il faudra vérifier le bon fonctionnement de ta machine

 

J'espère ne pas avoir été trop long

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[Micky_mike]

Euh j'suis sous XP... J'enlève tout? Que la WU?

 

Merci

[BOBPILOU]

Si c'était moi, je supprimerai tout et je réinstallerai tout depuis le début.....comme ça, tout est tout beau tout neuf....