Folding : le topic

[Cobra]

Client 5.04 text-only console pour Windows NT/2000/XP/Vista - lancement d'une seule console

 

 

Voici la page de téléchargement du site officiel.

 

Le fichier que vous avez téléchargé n'est pas un "installer" mais un exécutable. Il n'y a donc pas de procédure d'installation particulière.

 

1 - Vous créez un répertoire dans Program Files que vous nommerez par exemple Folding1.

Sous Vista, il est recommandé de créer le répertoire directement dans le répertoire racine (C:\ Folding1).

 

2 - Vous y mettez l'exécutable téléchargé.

 

3 - Vous créez un raccourci de l'exécutable pour la commodité de lancement et d'éventuelles modifications de configuration dans l'avenir.

Vous le placez par exemple sur le bureau pour l'avoir à portée de main (cela dans le but d'une configuration en mode "console" et non en "service").

 

4 - Vous double-cliquez sur le raccourci et une fenêtre particulière (msdos) s'ouvre, c'est la console (votre connexion internet doit être activée).

Et c'est là que vous allez d'abord configurer votre client, puis suivre l'avancement du traitement de l'unité de travail.

 

 

Le client est en attente que vous entriez les éléments de configuration.

Les réponses aux questions sont suggérées entre les [crochets]. Si vous êtes d'accord, vous pouvez tout simplement taper sur la touche "Entrée"

 

 

Vous entrez ici votre pseudo sous la forme [Zebulon.fr]_pseudo (les crochets et Zebulon.fr sont impératifs, sans oublier le _)

 

 

Les plieurs de Zebulon sont associés à l'Alliance Francophone reconnue sous le numéro 51

 

 

Nous préconisons de répondre "no" et ainsi pouvoir lancer la console manuellement, en toute transparence.

En cas de problème, vous pourrez plus facilement apporter les corrections adéquates nécessaires pour une nouvelle configuration.

Avec "yes", la console se lance automatiquement au démarrage de l'ordinateur (dans ce cas, le raccourci créé plus haut n'a plus sa raison d'être).

 

 

Si vous avez une connexion permanente à internet, répondez "no", sinon répondez "yes".

Si vous répondez "yes", lorsque le traitement sera achevé et que le client aura besoin de se connecter, il vous le demandera par l'affichage d'une petite fenêtre.

 

 

Si vous utilisez Internet Explorer 6, vous répondez "yes", pour Internet Explorer 7 ou tout autre navigateur, vous répondez "no".

En répondant "no", on vous demandera si vous utilisez un proxy. Rares sont les particuliers qui utilisent un proxy, vous répondez "no".

Mais si vous en utilisez un (vu dans Options Internet), répondez "yes" et une ligne supplémentaire s'affichera où vous mettrez le script de connexion.

 

 

Si vous avez une connexion internet 56k, mettez "no" ! Si vous avez une connexion haut débit et environ 1024 Mo de mémoire, mettez "yes".

Avec "yes", vous aurez de plus grosses protéines utilisant plus de mémoire vive et vous rapportant plus de points.

 

 

Vous mettez "yes" pour avoir accès à une configuration avancée.

 

 

Vous pouvez laisser "idle".

 

 

100 % est la valeur par défaut, de toute façon l'utilisation CPU diminuera en fonction de la sollicitation de l'ordinateur par son utilisateur.

 

 

Il est bien sûr préférable que les optimisations CPU soient activées. Il n'y a donc pas lieu de les désactiver, vous mettez "no".

 

 

Pour un ordinateur de bureau, vous mettez "no". Pour un ordinateur portable travaillant sur batterie, vous mettez "yes".

Notons que pour un ordinateur portable, dans le cadre de folding, il est préférable de le faire fonctionner sur secteur et donc de mettre "no".

 

 

Le programme fera périodiquement une sauvegarde. 15 minutes est un bon compromis.

Mais si vous devez souvent fermer la console, vous pouvez descendre au minimum.

 

 

C'est la mémoire que vous allouez au programme, ce qui ne veut pas dire qu'il va vraiment s'en servir dans la totalité.

Actuellement il est loin d'arriver à 512 Mo, quel que soit le client.

 

 

Vous pouvez laisser "no" par défaut. De toute façon, il n'existe plus d'unité sans deadline.

 

 

Mettez "yes" pour avoir des unités expérimentales à plus fort rendement de points. Notons que ce ne sera pas systématique.

 

 

Naturellement votre ordinateur est en parfait état de fonctionnement, vous mettez "no".

 

 

Vous avez installé un seul client sur cette machine, vous mettez "1".

 

 

Le logiciel client télécharge l'unité brute.

 

 

Et le traitement démarre... pourcentage par pourcentage jusqu'à 100 %.

 

 

Client 5.04 text-only console pour Windows NT/2000/XP/Vista - lancement de deux consoles

 

Si vous possédez un ordinateur de type Pentium 4 avec HyperThreading (mono processeur avec simulation d'un deuxième processeur), vous pouvez lancer deux consoles du client 5.04 en même temps.

 

Il en est de même, si vous avez un ordinateur dualcore qui est trop lent pour le client SMP dont la deadline (délai de traitement) est trop courte ou si vous ne pouvez pas le faire fonctionner suffisamment en continu pour tenir le délai imparti.

 

La procédure est très simple :

 

1 - Pour le 1er client 5.04, vous procédez exactement comme décrit plus haut, à la seule différence que, dans la cible du raccourci, vous devez mettre le paramètre -local.

Vous faites clic droit sur le raccourci, vous sélectionnez "Propriétés" et vous écrivez -local (avec un espace devant) :

 

 

2 - Pour le 2ème client 5.04, vous créez un autre répertoire, comme décrit précédemment, que vous nommez par exemple Folding2.

 

3 - Vous y mettez un autre exécutable et vous créez un second raccourci (Folding2) avec le paramètre -local comme pour la première console.

 

4 - Vous configurez exactement comme pour la 1ère console, à la seule différence que, pour la dernière ligne de configuration, vous devez impérativement mettre un autre numéro ID Machine. Vous pouvez inscrire "2". Si vous inscrivez le même numéro d'identification pour les deux consoles, la deuxième console que vous voulez lancer s'ouvrira bien mais se refermera immédiatement.

 

Petites remarques

 

- Vous pouvez minimiser la console ouverte en cliquant sur le symbole habituel pour minimiser une fenêtre.

 

- Pour fermer une console proprement, elle doit être active et vous faites un Ctrl+c tout simplement.

 

- Pour la lancer ou relancer, vous double-cliquez sur le raccourci.

Modifié le 6 avril 2009 par Cobra

[Cobra]

Client unifié Linux 6.02 pour mode Uniprocesseur et mode SMP

 

 

Précision importante : Réservez ce client pour une distribution 32 bits. Si vous utilisez une distribution 64 bits, il est recommandé de choisir le client 6.29 beta Linux plus évolué.

 

Nous vous rappelons la page de téléchargement du site officiel.

 

Notons tout d'abord que le client 6.02 est à même de fonctionner en mode Uniprocesseur sous Linux 32 bits ou 64 bits, afin de traiter les WU classiques. D'ailleurs, il fonctionne ainsi, par défaut, c'est-à-dire sans le paramètre -smp.

 

Pour le mode SMP, il faut absolument une distribution Linux x86-64 bits multi-processeurs.

Pour cette distribution 64 bits, il faut savoir qu'une petite librairie 32 bits doit obligatoirement être installée après téléchargement, si elle n'est pas déjà incluse dans votre distribution, trop ancienne :

 

sudo apt-get install ia32-libs

 

Par ailleurs, au cours de la configuration du client, un passkey sera demandé. Il est fourni par Stanford et vous est envoyé par mail.

Pour des infos sur ce passkey et comment l'obtenir :

http://folding.stanford.edu/English/FAQ-v6#ntoc3

http://fah-web.stanford.edu/cgi-bin/getpasskey.py

Mais il est à noter que le passkey n'est pas encore obligatoire.

 

Voici la procédure officielle de téléchargement, d'installation et de lancement, en ligne de commande, à partir du Terminal :

 

1 - Création du répertoire pour folding : mkdir -p ~/folding

 

2 - Ouverture du dossier : cd ~/folding

 

3 - Téléchargement du client : wget http://www.stanford.edu/group/pandegroup/folding/release/FAH6.02-Linux.tgz

 

4 - Dézipage du fichier téléchargé (pour un fichier qui se nomme FAH6.02-Linux.tgz) : tar xzf FAH6.02-Linux.tgz

 

5 - Configuration du client : ./fah6 -configonly

 

 

Le client est en attente que vous entriez les éléments de configuration.

Les réponses aux questions sont suggérées entre les [crochets]. Si vous êtes d'accord, vous pouvez tout simplement presser sur la touche "Entrée".

 

 

User name [Anonymous]?

Vous entrez ici votre pseudo sous la forme [Zebulon.fr]_pseudo (les crochets et Zebulon.fr sont impératifs, sans oublier le _)

 

Team Number [0]?

Les plieurs de Zebulon sont associés à l'Alliance Francophone reconnue sous le numéro 51.

 

Passkey []?

Vous entrez votre passkey si vous le souhaitez.

 

Ask before fetching/sending work <no/yes> [no]?

Si vous avez une connexion permanente à internet, répondez "no", sinon répondez "yes".

Si vous répondez "yes", lorsque le traitement sera achevé et que le client aura besoin de se connecter, il vous le demandera par l'affichage d'une petite fenêtre.

 

Use proxy <yes/no> [no]?

Rares sont les particuliers qui utilisent un proxy, vous répondez "no".

Mais si vous en utilisez un (vu dans Options Internet), répondez "yes" et une ligne supplémentaire s'affichera où vous mettrez le script de connexion.

 

Acceptable size of work assignment an work result packets...

Si vous avez une connexion internet 56k, mettez "small" ! Si vous avez une connexion haut débit et suffisamment de mémoire, mettez "normal" ou "big".

Avec "big", vous aurez de plus grosses protéines utilisant plus de mémoire vive et vous rapportant plus de points.

 

Change advanced options <yes/no> [no]?

Mettez "yes" pour avoir accès à une configuration avancée.

 

Core Priority <idle/low> [idle]?

Vous pouvez laisser "idle".

 

Disable highly optimized assembly code <no/yes> [no]?

Il est bien sûr préférable que les optimisations soient activées. Il n'y a donc pas lieu de les désactiver, vous laissez "no".

 

Interval, in minutes, between checkpoints <3/30> [15]?

Le programme fera périodiquement une sauvegarde, en plus de la sauvegarde réalisée à chaque pourcent. Vous pouvez laisser 15 mn par défaut.

 

Memory, in MB, to indicate...

C'est la mémoire que vous allouez au programme, ce qui ne veut pas dire qu'il va vraiment s'en servir dans la totalité.

Actuellement il est loin d'arriver à 512 Mo, quel que soit le client. Vous pouvez laisser tel quel.

 

Set -advmethods flag always...

Mettez "yes" pour avoir des unités expérimentales à plus fort rendement de points. Notons que ce ne sera pas systématique.

 

Ignore any deadline information...

Vous pouvez laisser "no" par défaut. De toutes façons, il n'existe plus d'unités sans deadline.

D'autant plus que votre ordinateur est en parfait état de fonctionnement, n'est-ce pas ?

 

Machine ID <1-16> [1]?

C'est le numéro par défaut, vous pouvez le laisser, en pressant la touche "Entrée", si vous ne l'avez pas déjà affecté à un autre client.

 

Vous avez terminé la procédure de configuration et vous allez maintenant lancer la procédure de traitement proprement dit.

 

6 - Lancement du traitement, toujours à partir de la fenêtre du Terminal :

 

- pour un lancement en mode Uniprocesseur : ./fah6 -verbosity 9

 

- pour un lancement en mode SMP : ./fah6 -smp -verbosity 9

 

Le logiciel client télécharge le logiciel de calcul (FahCore) et l'unité brute.

 

 

Et le traitement démarre... pourcentage par pourcentage jusqu'à 100 %, puis les résultats sont envoyés sur les serveurs de Stanford.

Et une autre unité de travail est téléchargée automatiquement pour traitement, et ainsi de suite...

 

Remarques

 

- Vous pouvez minimiser la console ouverte en cliquant sur le symbole habituel pour minimiser une fenêtre.

 

- Pour fermer une console proprement, elle doit être active et vous faites un Ctrl+c tout simplement.

 

- Pour la lancer ou relancer, vous devez le faire en ligne de commande, à partir du Terminal :

 

cd ~/folding

./fah6 -verbosity 9 (mode Uniprocesseur) ou ./fah6 -smp -verbosity 9 (mode SMP)

 

Rappel

 

Ce client V6 est à même de pouvoir traiter les WU SMP (avec le paramètre -smp) et les WU classiques pour uniprocesseur (la procédure d'installation est la même et on ne met pas le paramètre -smp).

Modifié le 7 février 2010 par Cobra

[Cobra]

La PlayStation 3 de Sony

 

Folding@Home a une installation native sur la console de Sony mais une mise à jour peut s'avérer nécessaire.

Une connexion à internet est nécessaire.

 

1 - Mettez à jour le firmware si la machine est neuve (mise à jour système) !

De toute façon, le programme vous le demande à l'allumage et vous suivez les instructions pas à pas.

 

2 - Sélectionnez "Réseau", et Life With Playstation doit s'afficher !

Si votre version folding est trop ancienne, c'est Folding@Home qui s'affichera et en le sélectionnant, une mise à jour sera proposée.

Vous suivez les instructions pas à pas, jusqu'à pouvoir obtenir cet écran en sélectionnant "Réseau", comme dit précédemment !

 

 

3 - Pressez sur le bouton "X" de la manette !

 

 

C'est l'écran du Live Channel qui vous permet de naviguer de ville en ville et de suivre l'actualité en live.

 

Mais ce dont vous ne vous doutez pas, c'est que folding est lancé en même temp et travaille en arrière plan.

 

Pour les Donateurs qui ont déjà paramétré avec pseudo, équipe, etc... les paramètres sont bien là, également en arrière-plan.

Pour les nouveaux venus, il faut passer à une autre étape.

 

3 - Appuyez sur le bouton carré de la manette et Folding@Home apparaîtra ! Sans relâcher le bouton carré, sélectionnez Folding@Home avec flèche bas, puis relâchez le bouton carré !

 

 

Vous êtes sur le Canal Folding@Home et vous pouvez voir l'avancement des calculs ainsi que les informations sur la protéine traitée.

Si vous êtes nouveau venu, votre pseudo de Donateur est par défaut en anonyme.

 

4 - Pour une configuration personnalisée, appuyez sur le bouton "Triangle" de la manette !

 

 

5 - Sélectionnez "Canal actuel" et acceptez avec le bouton "X" de la manette !

 

 

Voici ce que vous devez savoir de plus utile pour vos réglages et votre information :

 

- Dans "Paramètres", vous pouvez choisir entre le "Mode normal" (unité de travail d'environ 8 h de traitement) et le "Mode avancé" (temps de traitement plus long et gain plus important)

 

- Dans "Informations", vous pouvez voir les statistiques générales ou les vôtres personnellement.

 

- Dans "Supports visuels", vous avez le choix entre plusieurs supports mais le plus simple est le mieux afin de laisser plus de puissance à la simulation.

 

- Dans "Identité", vous entrez votre pseudo et votre équipe (51) - Pour un membre de Zebulon, il faut entrer [Zebulon.fr]_votrepseudo

 

Quand vous avez terminé, vous pressez sur le bouton "Précédent" de la manette pour revenir au précédent menu.

 

6 - Sélectionnez "Configuration" et acceptez avec le bouton "X" de la manette !

 

 

- "Economiseur d'écran" : sélectionnez et acceptez pour cocher !

 

- "Effets sonores" : si vous voulez entendre un son lorsque vous passez d'une rubrique à l'autre, sélectionnez et acceptez pour cocher !

 

- "Démarrage automatique" : vous avez le choix entre démarrer votre PS3 directement sur l'écran Folding@Home ou le bureau.

 

Quand vous avez terminé, vous pressez sur le bouton "Précédent" de la manette pour revenir au précédent menu.

 

7 - Sélectionnez "Musique" et acceptez avec le bouton "X" de la manette !

 

Ici, vous pouvez activer la musique lorsque ça calcule et choisir les pistes ou bien désactiver la musique (ça prendra moins de ressource et de toutes façons, lorsque la PS3 plie, vous éteignez votre écran télé pour économie d'énergie ).

 

Vous avez terminé et vous pouvez revenir à votre bel écran où vous voyez l'avancement de vos calculs...

 

Petites informations complémentaires

 

- Pour revenir au "Channel Live" et visiter les villes, appuyez sur le bouton carré de la manette et Live Channel apparaîtra ! Sans relâcher le bouton carré, sélectionnez Live Channel avec flèche bas, puis relâchez le bouton carré !

 

- Pour arrêter le repliement, afin de vous adonner à vos jeux préférés ou regarder un film ou pour toute autre application, pressez le bouton P de la manette et acceptez !

Vous revenez ainsi au bureau de la PS3.

 

Il est à noter que "Life With Playstation", intégrant Folding@Home en arrière-plan, est une application à part entière. On ne peut rien faire d'autre.

Modifié le 12 octobre 2008 par Cobra

[BOBPILOU]

bon sang Cobra, je m'absente quelques heures et je vois que t'as tout refait comme le souhaitait le méchant modo?

 

 

Bon, le méchant modo, il ne te reste plus qu'à copier/coller la page d'accueil refaite par Cobra et la mettre en page 1 à la place de la vieille.....C'est pas trop compliqué à faire

 

Et juste après ça, on pourra tous boire un coup pour fêter le relooking du folding sur Zeb!

 

[TheClem]

Tu oublie le passage ou je massacre tout pendant des heures ... parce que sur certains passages Cobra en fait un peu trop

[BOBPILOU]

Salut méchant modo!

 

Ben pour une fois, si tu pouvais t'abstenir de massacrer quelque chose sur ton passage, ce serait bien...

 

Plus sérieusement, je ne vois pas ce qui est "de trop". On refait la page pour expliquer clairement le truc. Parce que si c'est pour qu'à chaque fois, le nouveau plieur poste pour dire "j'ai pas tout compris, comment je fais?", ça n'aura servi à rien.....

 

Me fais-je bien comprendre?

[Cobra]

Tu oublie le passage ou je massacre tout pendant des heures ... parce que sur certains passages Cobra en fait un peu trop

 

Hein ? moi pas comprendre... Expliquez plus clairement là !

 

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Moi, je calcule des protéines...

Fondamental pour la recherche médicale... Cancer - Parkinson - Alzheimer - Creutzfeld Jakob...

Folding@Home : http://forum.zebulon.fr/index.php?showtopic=44617

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[TheClem]

[...] le but premier du contributeur est d'apporter son aide à une humanité souffrante.

 

On n'est pas les sauveteurs de l'humanité non plus, on apporte juste de la puissance de calculs à des chercheurs.

 

Les résultats sont là :

http://folding.stanford.edu/English/Papers

[TheClem]

Bien évidemment je vais chercher à prendre le meilleur de l'ancien topic et du nouveau, on ne va pas jeter le travail des anciens contributeurs. Mais si finalement le nouveau topic est bien meilleur fatalement c'est tout son contenu qui sera utilisé.

 

Ceci dit je félicite et je remercie Cobra pour l'important travail effectué.

[TheClem]

Plus sérieusement, je ne vois pas ce qui est "de trop". On refait la page pour expliquer clairement le truc. Parce que si c'est pour qu'à chaque fois, le nouveau plieur poste pour dire "j'ai pas tout compris, comment je fais?", ça n'aura servi à rien.....

 

Me fais-je bien comprendre?

 

Compare la taille des premières parties de l'ancien topic et celles du nouveau, si le nouveau plieur doit se voir décourager par une introduction qui s'éternise ce n'est pas intéressant non plus ... C'est pour ça que je souhaite qu'on réfléchisse un peu avant d'intégrer directement la contribution de Cobra, il y a peut être des modifications à faire.

 

Pas de smiley sarcastique avec moi, merci.