Folding : le topic

[Cobra]

Bienvenue kana-chan Pour un rapide, en voilà un rapide et même pas besoin de notre aide... pffffttt

 

Par contre, en effet, julien nous mobilise comme 2x15 mais je suis sûr qu'on va y arriver.

 

Julien, tu as parlé à un moment donné des 2 cores occupés à 100%, 8 process fahcore, etc... et comme on n'est pas sur ton épaule pour vraiment tout vérifier, il vaut mieux recommencer la procédure, à partir d'un certain stade.

 

1 - Arrête les calculs par Ctrl+c, attends quelques secondes que les process s'arrêtent bien et ferme ta fenêtre

 

2 - reboot ton pc (pour le cas où un truc tournerait dans le vide et prendait tes ressources)

 

3 - tu ouvres ton dossier folding avec le terminal : cd ~/folding

 

4 - tu lances ton client par : ./fah6 -verbosity 9 -config

 

5 - tu tombes sur cette fenêtre (avec tes arguments) :

 

 

et à partir de là tu configures en commençant par entrer : [Zebulon.fr]_julien88

 

et, ligne à ligne, tu rentres exactement comme dans cette capture :

 

 

En fait, il n'y a pas grand chose à rentrer, à part

[Zebulon.fr]_julien88

51 pour la team

big à Acceptable size of work...

yes à Change advanced options

yes à Set -advmethods

 

et pour tout le reste tu presses sur "Entrée"...

 

Et zou... bon pliage !

 

Si tu vérifies ton utilisation cpu, tu devrais être à 50 %, vu qu'un seul core est occupé.

[Marc-93]

Salut a tous

 

Il y a un petit probleme avec le folding , en effet je crois qu'il m'a « sauté « une WU 2665 a 1920 points. Si celle qu'il a envoyé le 23/4 a 23h10 est bien affichée sur kakaostat, en comptant le decalage horaire, celle de 17h39 est passée a la trappe.Est-ce un bug chez Stanford ou chez moi ?

 

Si quelqu'un peut examiner le log et voir s'il y a une explication car il a attaqué une nouvelle WU qui doit finir ce soir et je ne voudrai pas que ca se reproduise.

 

Si il y a quelque chose a changer, pas de termes trop techniques svp mon niveau ne c'est pas beaucoup amélioré a la lecture des posts .Je ne comprends pas la moitié du quart de ce que vous y écrivez.

 

 

 

Avec mes remerciements.

 

Bon weekend a tous

[DKlâgOR]

25/04/2009

Me

s

s

age du jour automati

s

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du 24 avril

[Zebulon.fr]_

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K

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1 750 000 point

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Lord

.

K

ana-chan

vient de rallier la zebteam avec

s

a premi

è

re wu.

 

Exceptionnellement, je rajoute un petit résumé des derniers évènements :

 

• En page d'accueil du forum, le lien sous la rubrique "L'équipe Zebulon.fr de Folding@home" ne conduit plus au dossier du site (Participer à Folding@home, 2 pages datant de 2004), mais a été redirigé vers notre nouveau topic épinglé en haut de Jrad : [iNFO] Folding@home, Votre ordi au secours de la recherche médicale.

Ce nouveau sujet est encore en construction, (merci d'ailleurs d'éviter pour l'instant de donner des liens vers ses posts, car ni leur contenu ni leur ordre n'est encore définitif) mais il est d'ores et déjà exclusivement destiné aux articles importants, à l'appréciation de Cobra. Tous les posts n'ayant pas reçu son aval express seront déplacés, par Florent ou tout autre modérateur plus rapide , vers notre bon vieux topic-fleuve habituel "Folding@home, Zébus, pliez !"

 

• Nous n'avons toujours pas d'écho concernant notre demande d'idées et d'aide postée dans le forum Participants : Pub pour le pliage...

 

• En ce qui concerne la campagne de mp, seule la liste des plieurs avance (petit à petit, et la mise en forme des codebox est en cours d'amélioration... ) (post #6226) et vient d'être mise est à jour : nous sommes désormais 40 bien réels plieurs actifs sur les 2 derniers mois.

La recherche des informations manquantes concernant les anciens plieurs est longue... elle pourra éventuellement être complétée ultérieurement.

Il reste toujours à rédiger le texte du mp à destination des anciens plieurs, et celui de la news à soumettre à Yann.

 

• Juju a finalement réussi à repérer le bon client dans la page Stanford, il en est à la config, et semble un peu bloquer sur le 51 : trop fort pour lui, vu son âge, c'est normal...

Le Jujuthon se poursuit, mobilisant une grande partie des ressources de la team.

Merci à Florent et KewlCat qui, malgré leur charge de modérateur, trouvent le temps de filer un coup de main, et affichent de plus leur soutien dans leur signature !

 

• Hier soir, Facks nous a signalé que le nouveau plieur qu'il a brillament recruté vient de terminer sa première wu : il s'agit de Kana-chan ([Zebulon.fr]_kana-chan), qui sera accueilli ici avec plaisir et diverses boissons règlementaires...

 

 

 

Et pour finir, la citation foldingue du samedi :

« My heart belongs to folding. » ♫

[Marilyn Monroe]

Modifié le 25 avril 2009 par DKlâgOR

[DKlâgOR]

Il y a un petit probleme avec le folding , en effet je crois qu'il m'a « sauté « une WU 2665 a 1920 points. Si celle qu'il a envoyé le 23/4 a 23h10 est bien affichée sur kakaostat, en comptant le decalage horaire, celle de 17h39 est passée a la trappe.Est-ce un bug chez Stanford ou chez moi ?

Hello Marc,

Les stats de l'AF semblent confirmer qu'il n'y ait eu qu'une wu (1920 pts) validée, malgré les deux "Thank you for your contribution" des fahlogs.

Il est possible que la première wu ait buggé, et qu'elle ne t'ait rapporté aucun point : peux-tu poster un extrait de son fahlog antérieur au [April 23 17:39:35 UTC] stp ?

 

Copie-colle simplement le fichier texte, entre balises [codebox] [/codebox] (éventuellement scindé en plusieurs parties)

 

 

edit 13h : Bonne fête Marc !

Modifié le 25 avril 2009 par DKlâgOR

[julien88]

Pfff ça m'énerve, j'ai tout bien configuré et tout ....

 

Pour être clair, combien de fahcore dois-je avoir normalement ? j'en ai 4 actuellement.

 

L'un de mes cores tourne à 100% et l'autre hocile entre 25 et 50 % et ils échangent parfois les rôles....

 

Et pour la config je comprend pas , j'ai même configuré deux fois...

 

Mon log allégé :

 

-- Opening Log file [April 24 17:02:16] 


# Linux Console Edition #######################################################
###############################################################################

				   Folding@Home Client Version 6.02

					  [url="http://folding.stanford.edu"]http://folding.stanford.edu[/url]

###############################################################################
###############################################################################

Launch directory: /home/julien/folding
Executable: /home/julien/folding/fah6


[17:02:16] Configuring Folding@Home...


[17:02:16] - Ask before connecting: No
[17:02:16] - User name: Anonymous (Team 0)
[17:02:16] - User ID not found locally
[17:02:16] + Requesting User ID from server
[17:02:16] - Machine ID: 1
[17:02:16] 
[17:02:16] Work directory not found. Creating...
[17:02:16] Could not open work queue, generating new queue...
[17:02:16] - Preparing to get new work unit...
[17:02:16] + Attempting to get work packet
[17:02:16] - Connecting to assignment server
[17:02:17] - Successful: assigned to (171.67.108.13).
[17:02:17] + News From Folding@Home: Welcome to Folding@Home
[17:02:17] Loaded queue successfully.
[17:02:22] + Closed connections
[17:02:22] 
[17:02:22] + Processing work unit
[17:02:22] Core required: FahCore_78.exe
[17:02:22] Core not found.
[17:02:22] - Core is not present or corrupted.
[17:02:22] - Attempting to download new core...
[17:02:22] + Downloading new core: FahCore_78.exe
[17:02:23] + 10240 bytes downloaded
[17:02:23] + 20480 bytes downloaded
[17:02:23] + 30720 bytes downloaded
[17:02:23] + 40960 bytes downloaded
[17:02:23] + 51200 bytes downloaded
[17:02:23] + 61440 bytes downloaded
....
[17:02:32] + 1095680 bytes downloaded
[17:02:32] + 1105920 bytes downloaded
[17:02:32] + 1116160 bytes downloaded
[17:02:32] + 1126400 bytes downloaded
[17:02:32] + 1134407 bytes downloaded
[17:02:32] Verifying core Core_78.fah...
[17:02:32] Bad file format for downloaded core bundle.
[17:02:32] Failed to verify core
[17:02:32] + Error: Could not extract core
[17:02:32] + Core download error (#2), waiting before retry...

[17:02:46] + Downloading new core: FahCore_78.exe
[17:02:47] + 10240 bytes downloaded
[17:02:47] + 20480 bytes downloaded
[17:02:47] + 30720 bytes downloaded
[17:02:47] + 40960 bytes downloaded
......
[17:02:56] + 1105920 bytes downloaded
[17:02:56] + 1116160 bytes downloaded
[17:02:56] + 1126400 bytes downloaded
[17:02:56] + 1134407 bytes downloaded
[17:02:56] Verifying core Core_78.fah...
[17:02:56] Signature is VALID
[17:02:56] 
[17:02:56] Trying to unzip core FahCore_78.exe
[17:02:56] - Couldn't open file FahCore_78.exe 
[17:02:56] + Error: Could not extract core
[17:02:56] + Core download error (#3), waiting before retry...

[17:03:08] + Downloading new core: FahCore_78.exe
[17:03:09] + 10240 bytes downloaded
....
[17:03:17] + 1116160 bytes downloaded
[17:03:17] + 1126400 bytes downloaded
[17:03:17] + 1134407 bytes downloaded
[17:03:17] Verifying core Core_78.fah...
[17:03:17] Signature is VALID
[17:03:17] 
[17:03:17] Trying to unzip core FahCore_78.exe
[17:03:17] - Couldn't open file FahCore_78.exe 
[17:03:17] + Error: Could not extract core
[17:03:17] + Core download error (#4), waiting before retry...

[17:03:39] + Downloading new core: FahCore_78.exe
[17:03:40] + 10240 bytes downloaded
[17:03:40] + 20480 bytes downloaded
[17:03:40] + 30720 bytes downloaded
...
[17:03:54] + 1126400 bytes downloaded
[17:03:54] + 1134407 bytes downloaded
[17:03:54] Verifying core Core_78.fah...
[17:03:54] Signature is VALID
[17:03:54] 
[17:03:54] Trying to unzip core FahCore_78.exe
[17:03:55] - Couldn't open file FahCore_78.exe 
[17:03:55] + Error: Could not extract core
[17:03:55] + Core download error (#5), waiting before retry...

[17:04:47] + Downloading new core: FahCore_78.exe
[17:04:48] + 10240 bytes downloaded
[17:04:48] + 20480 bytes downloaded
...
[17:05:03] + 1116160 bytes downloaded
[17:05:03] + 1126400 bytes downloaded
[17:05:03] + 1134407 bytes downloaded
[17:05:03] Verifying core Core_78.fah...
[17:05:03] Signature is VALID
[17:05:03] 
[17:05:03] Trying to unzip core FahCore_78.exe
[17:05:03] - Couldn't open file FahCore_78.exe 
[17:05:03] + Error: Could not extract core
[17:05:03] + Core download error (#6), waiting before retry...

[17:06:24] + Downloading new core: FahCore_78.exe
[17:06:26] + 10240 bytes downloaded
[17:06:26] + 20480 bytes downloaded
...
[17:06:43] + 1134407 bytes downloaded
[17:06:43] Verifying core Core_78.fah...
[17:06:43] Signature is VALID
[17:06:43] 
[17:06:43] Trying to unzip core FahCore_78.exe
[17:06:43] - Couldn't open file FahCore_78.exe 
[17:06:43] + Error: Could not extract core
[17:06:43] + Core download error (#7), waiting before retry...

[17:09:30] + Downloading new core: FahCore_78.exe
[17:09:31] + 10240 bytes downloaded
[17:09:31] + 20480 bytes downloaded
...
[17:09:50] + 1134407 bytes downloaded
[17:09:50] Verifying core Core_78.fah...
[17:09:50] Signature is VALID
[17:09:50] 
[17:09:50] Trying to unzip core FahCore_78.exe
[17:09:51] - Couldn't open file FahCore_78.exe 
[17:09:51] + Error: Could not extract core
[17:09:51] + Core download error (#, waiting before retry...

[17:15:17] + Downloading new core: FahCore_78.exe
[17:15:18] + 10240 bytes downloaded
...
[17:15:29] + 1126400 bytes downloaded
[17:15:29] + 1134407 bytes downloaded
[17:15:29] Verifying core Core_78.fah...
[17:15:29] Signature is VALID
[17:15:29] 
[17:15:29] Trying to unzip core FahCore_78.exe
[17:15:29] - Couldn't open file FahCore_78.exe 
[17:15:29] + Error: Could not extract core
[17:15:29] + Core download error (#9), waiting before retry...

[17:26:11] + Downloading new core: FahCore_78.exe
[17:26:20] + 10240 bytes downloaded
[17:26:21] + 20480 bytes downloaded
...
[17:27:32] + 1126400 bytes downloaded
[17:27:32] + 1134407 bytes downloaded
[17:27:32] Verifying core Core_78.fah...
[17:27:32] Signature is VALID
[17:27:32] 
[17:27:32] Trying to unzip core FahCore_78.exe
[17:27:33] Decompressed FahCore_78.exe (3435296 bytes) successfully
[17:27:33] + Core successfully engaged
[17:27:38] 
[17:27:38] + Processing work unit
[17:27:38] Core required: FahCore_78.exe
[17:27:38] Core found.
[17:27:38] Working on Unit 01 [April 24 17:27:38]
[17:27:38] + Working ...
[17:27:38] 
[17:27:38] *------------------------------*
[17:27:38] Folding@Home Gromacs Core
[17:27:38] Version 1.90 (March 8, 2006)
[17:27:38] 
[17:27:38] Preparing to commence simulation
[17:27:38] - Looking at optimizations...
[17:27:38] - Files status OK
[17:27:38] - Expanded 238603 -> 1166709 (decompressed 488.9 percent)
[17:27:38] 
[17:27:38] Project: 4456 (Run 560, Clone 4, Gen 13)
[17:27:38] 
[17:27:38] Assembly optimizations on if available.
[17:27:38] Entering M.D.
[17:27:58] (Starting from checkpoint)
[17:27:58] Protein: p4456_Seq50_Amber03
[17:27:58] 
[17:27:58] Writing local files
[17:28:16] Completed 13806 out of 1500000 steps  (1%)
[17:28:16] Extra SSE boost OK.
[17:29:47] Writing local files
[17:29:47] Completed 15000 out of 1500000 steps  (1%)
[17:51:24] Writing local files
[17:51:24] Completed 30000 out of 1500000 steps  (2%)
[18:12:23] Writing local files
[18:12:23] Completed 45000 out of 1500000 steps  (3%)

Folding@Home Client Shutdown.

 

Tu devrait être modo toi

Modifié le 25 avril 2009 par julien88

[DKlâgOR]

Salut Juju

Tu as bien repris TOUTE la procédure indiquée ce matin par Cobra au post 6583, hein ?

 

Qu'en est-il de l'utilisation cpu ?

S

i tu v

é

rifie

s

ton utili

s

ation cpu, tu devrai

s

ê

tre

à

50 %, vu qu'un

s

eul core e

s

t occup

é

.

edit : ok, vu. Mais 4 fahcore, ça me semble un peu trop même si je ne connais pas Linux.

Modifié le 25 avril 2009 par DKlâgOR

[DKlâgOR]

Julien, stp évite d'éditer pour répondre aux questions posées plus bas !

 

et remplace tes balises code par des codebox, stp !

 

[17:02:16] - User name: Anonymous (Team 0)

Toujours pas de 51, déjà...

[julien88]

C'est les log d'hier, je n'ai toujours pas modif

[DKlâgOR]

 

Reprends la procédure indiquée par Cobra ce matin.

[julien88]

Oui, attend, je viens juste de rentrer de deux heures de cours de math intensif

 

J'ai tout supprimé, tout repris à 0, au niveau des cores sa à l'air de marcher mais j'ai toujours les 4 fahcore avec 115 mo d'utilisation chacun !

 

Nouveau log :

 

--- Opening Log file [April 25 09:10:45] 


# Linux Console Edition #######################################################
###############################################################################

                      Folding@Home Client Version 6.02

                         [url="http://folding.stanford.edu"]http://folding.stanford.edu[/url]

###############################################################################
###############################################################################

Launch directory: /home/julien/folding
Executable: ./fah6
Arguments: -verbosity 9 -config 

[09:10:45] Configuring Folding@Home...


[09:12:03] - Ask before connecting: No
[09:12:03] - User name: [Zebulon.fr]_julien88_ (Team 51)
[09:12:03] - User ID not found locally
[09:12:03] + Requesting User ID from server
[09:12:03] - Getting ID from AS: 
[09:12:03] Connecting to [url="http://assign.stanford.edu:8080/"]http://assign.stanford.edu:8080/[/url]
[09:12:04] Posted data.
[09:12:04] Initial: E57D; - Received User ID = 7DE52D4A42C3D987
[09:12:04] - Machine ID: 1
[09:12:04] 
[09:12:04] Work directory not found. Creating...
[09:12:04] Could not open work queue, generating new queue...
[09:12:04] - Autosending finished units...
[09:12:04] Trying to send all finished work units
[09:12:04] + No unsent completed units remaining.
[09:12:04] - Autosend completed
[09:12:04] - Preparing to get new work unit...
[09:12:04] + Attempting to get work packet
[09:12:04] - Will indicate memory of 2025 MB
[09:12:04] - Detect CPU. Vendor: AuthenticAMD, Family: 15, Model: 3, Stepping: 3
[09:12:04] - Connecting to assignment server
[09:12:04] Connecting to [url="http://assign.stanford.edu:8080/"]http://assign.stanford.edu:8080/[/url]
[09:12:04] Posted data.
[09:12:04] Initial: 41AB; - Successful: assigned to (171.65.103.162).
[09:12:04] + News From Folding@Home: Welcome to Folding@Home
[09:12:05] Loaded queue successfully.
[09:12:05] Connecting to [url="http://171.65.103.162:8080/"]http://171.65.103.162:8080/[/url]
[09:12:11] Posted data.
[09:12:11] Initial: 0000; - Receiving payload (expected size: 2995663)
[09:12:21] - Downloaded at ~292 kB/s
[09:12:21] - Averaged speed for that direction ~292 kB/s
[09:12:21] + Received work.
[09:12:21] + Closed connections
[09:12:21] 
[09:12:21] + Processing work unit
[09:12:21] Core required: FahCore_78.exe
[09:12:21] Core not found.
[09:12:21] - Core is not present or corrupted.
[09:12:21] - Attempting to download new core...
[09:12:21] + Downloading new core: FahCore_78.exe
[09:12:21] Downloading core (/~pande/Linux/x86/Core_78.fah from www.stanford.edu)
[09:12:22] Initial: AFDE; + 10240 bytes downloaded
[09:12:22] Initial: CC14; + 20480 bytes downloaded
...
[09:12:25] Initial: EF43; + 1126400 bytes downloaded
[09:12:25] Initial: 6B45; + 1134407 bytes downloaded
[09:12:25] Verifying core Core_78.fah...
[09:12:25] Signature is VALID
[09:12:25] 
[09:12:25] Trying to unzip core FahCore_78.exe
[09:12:25] Decompressed FahCore_78.exe (3435296 bytes) successfully
[09:12:25] + Core successfully engaged
[09:12:31] 
[09:12:31] + Processing work unit
[09:12:31] Core required: FahCore_78.exe
[09:12:31] Core found.
[09:12:31] Working on Unit 01 [April 25 09:12:31]
[09:12:31] + Working ...
[09:12:31] - Calling './FahCore_78.exe -dir work/ -suffix 01 -checkpoint 15 -verbose -lifeline 9790 -version 602'

[09:12:31] 
[09:12:31] *------------------------------*
[09:12:31] Folding@Home Gromacs Core
[09:12:31] Version 1.90 (March 8, 2006)
[09:12:31] 
[09:12:31] Preparing to commence simulation
[09:12:31] - Looking at optimizations...
[09:12:31] - Created dyn
[09:12:31] - Files status OK
[09:12:32] - Expanded 2995151 -> 15100189 (decompressed 504.1 percent)
[09:12:32] - Starting from initial work packet
[09:12:32] 
[09:12:32] Project: 2498 (Run 7, Clone 1, Gen 1)
[09:12:32] 
[09:12:32] Assembly optimizations on if available.
[09:12:32] Entering M.D.
[09:12:39] Protein: Translocon_GLX2
[09:12:39] 
[09:12:39] Writing local files
[09:12:39] Extra SSE boost OK.
[09:12:40] Writing local files
[09:12:40] Completed 0 out of 250000 steps  (0%)

 

J'ai essayé d'installer ia32libs et sa me renvoie "error : wrong architechture amd64"

 

ia32 shared libraries for use on amd64 and ia64 systems

This package contains runtime libraries for the ia32/i386 architecture, configured for use on an amd64 or ia64 Debian system running a 64-bit kernel.

 

Par ailleurs il semble qu'il y est un problème d'heure dans les log ....

Modifié le 25 avril 2009 par julien88