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Folding@home : Rejoignez un projet scientifique généreux !!

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17082008124623223815230035.png Le projet Folding@home
Folding@home est un projet scientifique de calcul distribué à caractère biomédical, dont le but est d'étudier le processus de repliement des protéines en vue d'établir leur conformation finale. Il est mené depuis 2000 par le Pande Group, de l'Université Stanford en Californie (USA) et regroupe à ce jour plus de 1,9 millions de participants dans le monde entier.

► Un peu de biologie moléculaire : pourquoi le processus de repliement (folding) est-il si important ?
« En tant qu'éléments structurels, les protéines sont le composant principal de nos os, de nos muscles, de nos cheveux, de notre peau et de nos vaisseaux sanguins. En tant qu'anticorps, elles reconnaissent les éléments intrus et permettent au système immunitaire de se débarrasser des indésirables. »
source : Folding@home, Pande Group.
Un dysfonctionnement dans leur repliement amène à ce qui n'a pas lieu d'être, c'est-à-dire à des anomalies, causes essentielles des maladies dramatiques que sont les maladies du cancer, d'Alzheimer, de Creutzfeldt-Jakob, de Parkinson... Et nous savons que ces maladies touchent de plus en plus de personnes. Il est donc devenu vital de résoudre rapidement le mystère du repliement des protéines, grâce à une cartographie extrêmement précise.

► Le calcul distribué (distributed computing) : kézako ?
Le repliement des protéines étant trop rapide pour être observé in vivo, une équipe de recherche de l'Université de Stanford animée par le professeur Vijay Pande a décidé d'avoir recours à la simulation informatique pour remédier à cette impossibilité
Cette simulation nécessite une énorme puissance de calcul qui représente un investissement financier hors de portée de la plupart des services de recherche universitaires.
Pour obtenir la puissance de calcul nécessaire à un avancement rapide des recherches, le Pande Group fait appel, dans le monde entier, aux possesseurs d'ordinateurs personnels, disposant d'une connexion à l'Internet, pour offrir au projet la puissance inutilisée de leurs machines.

Le calcul distribué consiste ainsi donc tout simplement au découpage d'un calcul extrêmement complexe et long en milliers d'unités et de sous-unités indépendantes, dont le traitement est confié à une multitude d'ordinateurs bénévoles, de type ordinateur personnel.

En effet, sur un plan statistique, on peut constater que près de 95% de la puissance des ordinateurs de type personnel est inemployée. En clair : nos ordinateurs s'ennuient, puisqu'ils passent 95% de leur temps à attendre que nous leur fassions exécuter une tâche, laquelle tâche ne requiert que rarement la totalité de la puissance disponible.
Et là où la technologie Folding@home excelle, c'est qu'elle puise uniquement la puissance de calcul inutilisée de ces ordinateurs sur lesquels ses logiciels clients ont été installés : le calcul prendra 100 % des ressources pendant que l'utilisateur ne se sert pas de son ordinateur, et, cas extrême, pratiquement 0 % si l'ordinateur est énormément sollicité.
L'utilisateur aura donc toujours la main car le logiciel client installé sur sa machine travaille en priorité basse, et c'est ainsi que, dans ses travaux de tous les jours ou même avec des applications très gourmandes sur les machines plus modernes, il ne se rendra pratiquement pas compte du calcul effectué en arrière-plan, tout simplement parce que le traitement se mettra de façon dynamique au diapason des ressources restantes de l'ordinateur.

► À qui s'adresse-t-il ?
De par sa vocation universelle, humanitaire et altruiste (les résultats bruts des simulations sont mis gratuitement à disposition des chercheurs), le projet Folding@home connaît un immense succès. À un tel point que l'extraordinaire réussite de son portage sur la Playstation 3 de Sony l'a fait entrer dans le livre Guiness des records, en tant que réseau de calcul distribué le plus puissant de la planète.

En effet, chacun peut contribuer à l'avancée de la science !!
Vous avez décidé d'apporter votre pierre à ce noble édifice qu'est le projet Folding@home et vous vous demandez par où commencer ?
C'est très simple : pour participer, il suffit de télécharger sur le site de l'Université de Stanford un logiciel appelé client qui, une fois installé et configuré,va appeler un serveur de Folding@home, charger une unité de travail, effectuer les calculs, renvoyer les résultats au serveur, charger une nouvelle unité, et ainsi de suite, aussi longtemps que vous souhaiterez contribuer à ce projet scientifique.

► La compét...
Afin d'attirer et de fidéliser les participants, le staff de Folding@home a mis en place un système de rétribution : chaque unité de travail (WU) rendue rapporte un certain nombre de points au contributeur. Et pour susciter et entretenir l'esprit de compétition, un classement est établi. Le classement est individuel mais il est également tenu à jour par équipes.
Cependant, si suivre l'évolution de son classement est motivant en soi, le but premier du contributeur est d'apporter son aide aux chercheurs soucieux de faire avancer la recherche médicale. C'est pourquoi toute contribution est utile, même la plus petite : « les petits ruisseaux font les grandes rivières » !

Vous voulez en savoir plus sur le rôle capital que jouent les protéines dans nos organismes, l'objectif et les enjeux du projet Folding@home ? Visitez le site officiel ainsi que celui de l'Alliance Francophone dont notre équipe fait partie.
Vous voulez jouer à kikalaplusgrosse ? Rejoignez-nous !


17082008124623223815230035.png L'équipe Zebulon.fr
Historique
Notre site informatique Zebulon.fr a sa propre mini-équipe depuis juin 2004.
Le présent topic a été créé sur Zebulon conjointement par TheClem et Davy le 03/06/2004, et ce premier post a été plusieurs fois remanié, dont de 2004 à 2008 par TheClem et Greywolf, de 2009 à 2010 par Cobra, et à partir de 2018 par Zebteam Folding@home, notre compte collectif.
[à compléter]

► Nous rejoindre
Notre mini-équipe fait partie de l'équipe 51 qui est celle de l'Alliance Francophone.
Nos membres se reconnaissent à leur pseudo commençant par [Zebulon.fr]_ et à la bannière qu'ils peuvent arborer s'ils le souhaitent (voir ).
Lors de la configuration du logiciel client, que nous présentons plus loin, il est important de respecter les règles suivantes pour votre identification :
- name : [Zebulon.fr]_pseudo
- team number : 51
N'hésitez pas à rejoindre notre discussion ici sur ce topic !


17082008124623223815230035.png Tutoriels
► Pré-requis
- info sur les choix de l'identifiant et de l'équipe
► Recommandations concernant le choix et l'installation du client Folding@home
Depuis 2012[?], il n'existe qu'un client, unifié pour toutes les plateformes, qui est disponible sur la page Download du site officiel.
Pour toute information sur son installation et son utilisation, nous vous proposons de vous rendre sur la page des tutoriels réalisés par notre équipe (et n'hésitez pas à rejoindre notre discussion !)
► Installation
- tuto d'installation du client v7 Windows
- tuto d'installation du client v7 Linux
- guide d'utilisation du client v7 Chrome
► Configuration
- description du Web Control
- description de l'Advanced Control : présentation, contrôleur, paramètres
- monitoring via le contrôleur


17082008124623223815230035.png Topics et liens externes
► Nos topics
Folding@home : le topic : c'est celui-ci, notre topic-fleuve, tout le bla-bla quotidien, avec à ce jour plus de 13 000 messages depuis mai 2004
Folding@home : INFO : présentation de Folding@home, tutos et articles (NB : réservé à Zebteam)

Folding@home : l'actu de la zebteam : présentation de la zebteam et résumé des évènements folding sur Zeb
Folding@home : la galerie de la zebteam : les zebplieurs se racontent...
Folding@home : les stats : gestion des statistiques Folding@home de l'Alliance Francophone par Kana-chan

► Nos articles
- article sur la structure des protéines : pour en apprendre davantage sur les protéines
► Liens externes
- site officiel du projet : folding.stanford.edu
- site de l'Alliance Francophone : Folding@home, un projet scientifique généreux , Une protéine : tentative de vulgarisation à l'intention des foldingueurs, Folding@home : la règle du jeu, FAQ
- site Openclassrooms (ex-site du Zéro) : explications et tutos


17082008124623223815230035.png Classement des participants
- le projet Folding@home : classement mondial sur le site officiel, statistiques sur KakaoStats, statistiques sur EOC
- l'équipe de l'Alliance Francophone : classement des membres et des mini-teams
- la mini-team Zebulon.fr : liste des plieurs et classement de nos membres actifs

À bientôt ? 17082008195323223815230038.gif
l'équipe de Folding@home de Zebulon.fr

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edits

 

DK 07/03/2018 : modif titre + révision du contenu de 2010 merci à Dylav pour la ré-attribution du post de 2004 à Zebteam et à JWhy de l'AF pour les emprunts ; )
DK 26/05/2018 : rectifs mise en forme suite màj forum

Modifié par Zebteam Folding@home

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Heureux de vous revoir les amis et bravo encore à Yann pour la remise en route du forum :-(

 

Sinon, notre petite épopée dans le cadre du projet folding semble pas mal se débrouiller. D'après ce que j'ai pu voir 3 zébuliens dans les 90 000 premiers :-P

Ca bosse dur chez Zeb :P

 

Mais c'est pas encore gagné alors rameuter vos copains, on le va restructurer le Génome :-P

 

 

++

 

[edit] heu au fait je suis inscrit depuis le 25/05 alors m'oublier passsssssssssssssss

[Zebulon.fr]_Kane179, et donc au moins 13 membres :-P [/edit]

Modifié par kane179

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Euh au fait , pourquoi JWhy est l'admin de notre mini-team :-(

 

j'ai rien contre ce "brave garcon" mais trouve bizarre que personne de chez nous le soit.

 

Laubean l'avait soit-disant fait :P

 

13 membres ... avec [zebulon.fr]_tbb !

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Hum, quitte à passer pour un boulet qui n'a pas suivi, je pose ma question. C'est quoi Folding@home exactement ?? :P

Tout le monde en parle, mais personne ne dit exactmeent ce que ça fait....

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