La disquette ne sert qu'à démarrer l'installation de Windows. 
Par contre du coup, le CD en first boot, tu peux oublier, ton CD ne pourra pas faire démarrer ta machine (comme la plupars des 98 d'ailleurs...). 
  
Pour avoir accès au lecteur CD en mode sans echec, il te faut éditer 2 fichier en premier lieux : 
  
Dans "démarrer" puis "executer" tape : notepad autoexec.bat 
  
dans la fenetre qui s'ouvre, à la fin du fichier ajoute une ligne : mscdex /d:ide01 
enregistre et ferme 
  
Dans "démarrer" puis "executer" tape : notepad config.sys 
  
dans la fenetre qui s'ouvre, à la fin du fichier ajoute une ligne : DEVICE=c:\windows\command\ebd\oakcdrom.sys /d:ide01 
enregistre et ferme 
  
Au redémarrage suivant, pour avoir ton CD en mode sans echec, tu choisira le démarrage en mode "pas à pas", tu diras oui à tout jusqu'à la ligne "mscdex /d:ide01" puis àprès cette ligne tu diras non à tout. 
  
Voilà, ça devrait fonctionner. 
Bon courrage