Folding : le topic

[ricou33]

J'suis bien content de faire avancer la science à nouveau mais alors par contre ils sont pas sympa avec moi pour le premier wu : 45 min pour faire 25000 steps alors qu'il a 95% du proc pour lui. Ca veut dire que dans le meilleur des cas pour terminer les 2 500 000 steps j'en ai pour 75 heures (le dernier wu que j'ai rendu m'avait prit 35 heures) donc je vais pas pouvoir rendre celui-ci avant la fin de la semaine prochaine, j'espère au moins que ca va me rapporter pas mal de points.

 

Au faite peut-on savoir combien un wu va nous rapporter ?

 

 

 

Réponse subsidiaire : désolé mais c'est "non".

[mofo]

Je suis en train de prospecter pour rjouter quelques comptes mofo in the world ... ben surtout en france.

 

+

[NIKOSIX]

Au faite peut-on savoir combien un wu va nous rapporter ?

428798[/snapback]

 

il y a EM3 qui te donne les points et temps nécessaire pour

calculer une WU.

[O.Fournier]

Salut tous,

 

j'ai récolté une sale grosse protéine p586_BBA5/POL3 qui pour la 1ère fois redémarre systématiquement depuis 2 jours au 5ème step sans aucune raison visible (notamment dés qu'on ferme F@H ou que je redémarre WinME normalement) :

[05:33:22] Folding@Home PMD Core

[05:33:22] Version 1.01 (Oct 15, 2004)

[05:33:22]

[05:33:22] Preparing to commence simulation

[05:33:22] - Looking at optimizations...

[05:33:22] - Files status OK

[05:33:36] - Expanded 408283 -> 3045421 (decompressed 745.9 percent)

[05:33:41] - Checksums don't match (work/wudata_01CP.arc)

[05:33:44] - Starting from initial work packet

[05:33:44]

[05:33:44] Project: 586 (Run 12, Clone 72, Gen 12)

[05:33:44]

[05:33:45] Assembly optimizations on if available.

[05:33:45] Entering M.D.

[05:34:23] Protein: p586_BBA5/POL3

[05:34:23]

[05:34:23] Completed 0 out of 50000 steps  (0)

[05:40:03] Writing checkpoint files

[05:46:20] Writing checkpoint files

[05:52:46] Writing checkpoint files

[05:59:09] Writing checkpoint files

[06:05:16] Writing checkpoint files

[06:11:17] Writing checkpoint files

[06:17:18] Writing checkpoint files

[06:23:39] Writing checkpoint files

[06:29:42] Writing checkpoint files

[06:35:17] Writing local files

[06:35:17] Completed 500 out of 50000 steps  (1)

[06:38:38] Writing checkpoint files

[06:47:36] Writing checkpoint files

[06:56:30] Writing checkpoint files

 

etc... (pas plus que 2500 et ça repart à zéro)

 

Ras le bol, je n'ai rien changé à ma config matérielle et logicielle qui tourne sans aucun pb, j'ai tout essayé, les sauvegardes/restaurations ne fonctionnent pas pour la 1ère fois depuis mai dernier

 

Où est le pb et comment faire pour s'en débarasser et en télécharger une autre ?

Modifié le 3 décembre 2004 par O.Fournier

[Y@kuz@]

Supprimer le répertoire work de ton repertoire FAH, quoique le meilleur moyen de repartir , tu copies le repertoire FAH en FAH², et tu supprimes tout sauf FAH502-Console.exe et client.cfg, normalement ca devrait reprendre un nouveau pliage...

[KewlCat]

Supprimer le répertoire work de ton repertoire FAH, quoique le meilleur moyen de repartir , tu copies le repertoire FAH en FAH², et tu supprimes tout sauf FAH502-Console.exe et client.cfg, normalement ca devrait reprendre un nouveau pliage...

429026[/snapback]

Ouais, sauf que s'il est vraiment maudit, le client.cfg va servir à le faire reconnaitre auprès de son serveur d'assignation et il va se re-choper la même WU (cela dit, je n'ai pas testé, peut-être que je suis pessimiste...)

[Y@kuz@]

Tu as peux être raison, il faudrait mieux se créer un nouveau client.cfg en effacant le premier et lancer FAH et le reconfigurer.

[O.Fournier]

Salut et merci.

 

Le problème était encore le même ce matin (miracle j'avais atteint 7 steps), aprés une nuit de pliage tous processes superflus arrêtés (antivirus, ZA, etc ..) : au reboot normal v'lan repartie à zéro !

 

Donc : action ce matin pour jeter cette protéine buggée ou intolérante (elle voulait tout mon ordi pour elle seule, non mais bonjour l'égocentrisme !)

 

La 1ère solution, la plus simple, a été la bonne : effacement des fichiers dans C: \PF...\F@H...\WORK (au cas où sauvegardés à côté dans un répertoire créé SAVWORK) et relance de F@H -> hop demande immédiate de connection et téléchargement d'une autre WU (Gromac p957_pa_drf2 toute petite !) qui tourne.... Voilà le début du log :

 

"..."

[08:19:17] Folding@home Core Shutdown: MISSING_WORK_FILES

[08:19:21] CoreStatus = 74 (116)

[08:19:21] The core could not find the work files specified. Removing from queue

[08:19:21] Deleting current work unit & continuing...

[08:19:25] - Preparing to get new work unit...

[08:19:44] + Attempting to get work packet

[08:19:44] - Connecting to assignment server

[08:19:46] - Successful: assigned to (171.65.103.153).

[08:19:46] + News From Folding@Home: Welcome to Folding@Home

[08:19:46] Loaded queue successfully.

[08:19:50] + Connections closed: You may now disconnect

[08:19:55]

[08:19:55] + Processing work unit

[08:19:55] Core required: FahCore_78.exe

[08:19:55] Core found.

[08:19:55] Working on Unit 02 [December 4 08:19:55]

[08:19:55] + Working ...

[08:19:56]

[08:19:56] *------------------------------*

[08:19:56] Folding@Home Gromacs Core

[08:19:56] Version 1.70 (October 24, 2004)

[08:19:56]

[08:19:56] Preparing to commence simulation

[08:19:56] - Looking at optimizations...

[08:19:56] - Created dyn

[08:19:56] - Files status OK

[08:19:56] - Expanded 51992 -> 272981 (decompressed 525.0 percent)

[08:19:56] - Starting from initial work packet

[08:19:56]

[08:19:56] Project: 957 (Run 57, Clone 82, Gen 10)

[08:19:56]

[08:19:56] Assembly optimizations on if available.

[08:19:56] Entering M.D.

[08:20:02] Protein: p957_pa_drf2

[08:20:02]

[08:20:02] Writing local files

[08:20:02] Using table 3

[08:20:03] Extra SSE boost OK.

[08:20:03] Writing local files

[08:20:03] Completed 0 out of 5000000 steps  (0)

..." etc ...

 

Voilà, si ça peut servir à d'autres, ne pas se compliquer la vie

Modifié le 4 décembre 2004 par O.Fournier

[sebastienserre]

Bonjour je suis nouveau dans l'equipe zebulon pour le folding.

 

Je suis sous linux et je voudrais que ca se lane automatiquement u demarrage du pc. comment dois je faire pour l'insta,nt j'aiune fenetre en ligne de commande d'ouverte . Puis je la fermer ?????

 

 

merci de m'éclairer !!!!

[artic]

e viens de reprendre les scripts de services Mandrake, et en voilà un à mettre dans /etc/rc.d/init.d/folding pour pouvoir lancer FAH avec la commande "service" (service  folding {start|stop|restart|status}).

 

#!/bin/sh
#
# folding:       Starts Folding@Home
#
# Version:      1.0
#
# chkconfig: 2345 98 98
# description: Starts and stops the Folding@Home client.
#
# processname: FAH502-Linux.exe
# config: /home/tifauv/folding/client.cfg
# hide: true

# Source function library.
. /etc/rc.d/init.d/functions

# A little tweaking is possible here
FAH_EXE='FAH502-Linux.exe'
FAH_USER='tifauv'
FAH_HOME="/home/$FAH_USER/folding"

# See how we were called.
case "$1" in
 start)
       gprintf "Starting Folding@Home client: "
       su - $FAH_USER -c "cd $FAH_HOME; ./$FAH_EXE >/dev/null &" > /dev/null
       touch /var/lock/subsys/folding
       echo
     ;;
 stop)
       gprintf "Shutting down Folding@Home client: "
       killproc $FAH_EXE -TERM
       rm -f /var/lock/subsys/folding
       echo
     ;;
 status)
       status $FAH_EXE
        if [ $? -eq 0 ]; then
                echo
                echo " >> La fin du journal est :"
                tail $FAH_HOME/FAHlog.txt
        fi
        echo
      ;;
 restart)
       gprintf "Restarting Folding@Home client. "
       if [ -f /var/lock/subsys/folding ]; then
           killproc $FAH_EXE -TERM
       fi
       su - $FAH_USER -c "cd $FAH_HOME; ./$FAH_EXE >/dev/null &" > /dev/null
       touch /var/lock/subsys/folding
       echo
     ;;
 *)
       gprintf "*** Usage: folding {start|stop|status|restart}\n"
       exit 1
esac

exit 0

 

Après la ligne "# A little tweaking is possible here", vous devez indiquer :

 

    * FAH_EXE  : le nom de l'exécutable (utile pour les mises à jour) ;

    * FAH_USER : le nom d'utilisateur sous lequel est exécuté FAH ;

    * FAH_HOME : le répertoire de base de FAH (par défaut, c'est /home/$FAH_USER/folding).

 

 

 

 

Pour automatiser le lancement, vous devriez pouvoir utiliser le centre de contrôle Mandrake (Système > Services) ou placer manuellement les liens symboliques dans /etc/rc.d/rc?.d.

 

 

Mais tu trouveras d'autres idées et plus d'infos sue le forum de l'alliancefrancophone.

Je te mets le lien du thread où j'ai piqué le quote ci-dessus :

mettre folding en service sous Mandrake 10

 

EDIT : Kewlcat a,d co : n'hésitez pas à rajouter quelquechose, je ne suis pas encore passé sous Linux et c'est du pur ctrl c - ctrl v, je ne comprends même pas ce que je copie.

Modifié le 4 décembre 2004 par artic