Folding : le topic

[Bull45]

Hummm.... Une fille !

Tinquiètes moi j'offre de tout

[Cobra]

Une histoire peut avoir plusieurs fins et aussi la fin qu'on veut bien lui donner

 

Moi, je vote pour la fin que korentin a embrouillé Windows qui beugue et ne voit que 2 cores au lieu de 4.

 

Et un élément faisant partie de la même fin, c'est qu'avec ou sans -deino, ça tourne puisque c'est quand même du MPI, mais c'est instable. Et qui dit instabilité ne dit pas forcément plantage immédiat mais plantage au moment où on s'y attend le moins.

 

Et encore une autre possible fin de l'histoire, si ça se trouve korentin va envoyer des résultats erronés et faire planter la simu à lui tout seul (c'est déjà arrivé il y a quelques mois avec de mauvais drivers GPU qui faisaient doubler les points mais les résultats étaient faux).

 

Bon dimanche à tous

[korentin]

Salut à tous,

Suis le mode d'emploi correctement et puis poste si ça va pas .

tu as sans doute raison. je ne dis pas qu'il ne faut pas suivre le mode d'emploi, le hasard (un oubli de ma part au départ) m'a mis dans cette situation étrange, je voudrais juste savoir pourquoi mon cpu est aussi efficace à 50 qu'à 100% (quoique maintenant c'est plutôt 70% )

Et un élément faisant partie de la même fin, c'est qu'avec ou sans -deino, ça tourne puisque c'est quand même du MPI, mais c'est instable. Et qui dit instabilité ne dit pas forcément plantage immédiat mais plantage au moment où on s'y attend le moins.

c'est aussi possible mais pour l'instant la 2665 est partie et la 2653 qui suit se passe correctement (un peu moins rapide qu'avec le client pich mais bull a expliqué pourquoi et la différence n'est pas telle que seulement 2 cores soient reconnus - 2550 ppd au lieu d'environ 2800 avant)

 

[21:25:38] Writing local files
[21:25:38] Completed 245000 out of 250000 steps  (98 percent)
[21:40:24] Writing local files
[21:40:25] Completed 247500 out of 250000 steps  (99 percent)
[21:55:12] Writing local files
[21:55:12] Completed 250000 out of 250000 steps  (100 percent)
[21:55:12] Writing final coordinates.
[21:55:13] Past main M.D. loop
[21:55:13] Will end MPI now
[21:56:13] 
[21:56:13] Finished Work Unit:
[21:56:13] - Reading up to 21310704 from "work/wudata_01.arc": Read 21310704
[21:56:13] - Reading up to 560532 from "work/wudata_01.xtc": Read 560532
[21:56:13] goefile size: 0
[21:56:13] logfile size: 230708
[21:56:13] Leaving Run
[21:56:16] - Writing 22108316 bytes of core data to disk...
[21:56:17]   ... Done.
[21:56:17] - Failed to delete work/wudata_01.sas
[21:56:17] - Failed to delete work/wudata_01.goe
[21:56:17] Warning:  check for stray files
[21:56:17] - Shutting down core
[21:58:17] 
[21:58:17] Folding@home Core Shutdown: FINISHED_UNIT
[21:58:17] 
[21:58:17] Folding@home Core Shutdown: FINISHED_UNIT
[21:58:19] CoreStatus = 64 (100)
[21:58:19] Sending work to server
[21:58:19] Project: 2665 (Run 0, Clone 353, Gen 130)


[21:58:19] + Attempting to send results [July 11 21:58:19 UTC]
[22:03:22] + Results successfully sent
[22:03:22] Thank you for your contribution to Folding@Home.
[22:03:22] + Starting local stats count at 1
[22:03:27] - Preparing to get new work unit...
[22:03:27] Cleaning up work directory
[22:03:27] + Attempting to get work packet
[22:03:27] - Connecting to assignment server
[22:03:28] - Successful: assigned to (171.64.65.64).
[22:03:28] + News From Folding@Home: Welcome to Folding@Home
[22:03:28] Loaded queue successfully.
[22:03:50] + Closed connections
[22:03:50] 
[22:03:50] + Processing work unit
[22:03:50] Work type a1 not eligible for variable processors
[22:03:50] Core required: FahCore_a1.exe
[22:03:50] Core found.
[22:03:50] Using generic mpiexec calls
[22:03:50] Working on queue slot 02 [July 11 22:03:50 UTC]
[22:03:50] + Working ...
[22:03:50] 
[22:03:50] *------------------------------*
[22:03:50] Folding@Home Gromacs SMP Core
[22:03:50] Version 1.76 (February 23, 2008)
[22:03:50] 
[22:03:50] Preparing to commence simulation
[22:03:50] - Ensuring status. Please wait.
[22:03:50] - Files status OK
[22:03:52] - Expanded 2429781 -> 12901369 (decompressed 530.9 percent)
[22:03:53] - Starting from initial work packet
[22:03:53] 
[22:03:53] Project: 2653 (Run 11, Clone 83, Gen 130)
[22:03:53] 
[22:03:53] Assembly optimizations on if available.
[22:03:53] Entering M.D.
[22:04:10] l work packet
[22:04:10] 
[22:04:10] Project: 2653 (Run 11, Clone 83, Gen 130)
[22:04:10] 
[22:04:10] Entering M.D.
[22:04:31] Rejecting checkpoint
[22:04:32] Protein: Protein in POPC
[22:04:32] xtra SSE boost OK.
[22:04:32] 
[22:04:33] Extra SSE boost OK.
[22:04:33] Writing local files
[22:04:33] Completed 0 out of 500000 steps  (0 percent)
[22:14:27] Writing local files
[22:14:28] Completed 5000 out of 500000 steps  (1 percent)
[22:24:23] Writing local files
[22:24:23] Completed 10000 out of 500000 steps  (2 percent)
[22:34:21] Writing local files
[22:34:21] Completed 15000 out of 500000 steps  (3 percent)
[22:44:17] Writing local files
[22:44:17] Completed 20000 out of 500000 steps  (4 percent)
[22:54:13] Writing local files
[22:54:14] Completed 25000 out of 500000 steps  (5 percent)

 

je laisse passer le WE et je reviendrai dans le droit chemin mais j'aurai aimé avoir le fin mot de l'histoire

Modifié le 12 juillet 2009 par korentin

[anthome_vedene]

Bon dimanche à toutes et tous, salut à toi Korentin, et à toi aussi, Cobra

 

Je vote pour !, et d'acc-o-d'acc avec OlivierZ pour le lien ici (mais j'ai vu que DK avait retenu l'idée).

Mon absence prolongée du forum ne m'a pas empêché de le suivre régulièrement et j'avais prévu de venir voter avant midi (ferment tôt, les bureaux de vote, cette année ! ). Mais l'annonce du MP de Facks m'a obligé à me remuer les miches. Il y a une dizaine de jours, j'ai connu quelques soucis (BSOD, recherche du pb, en désespoir de cause, réinstall de windows, et reconfiguration du tout : catalyst 9.4 avec dll optimisées, client gpu, client SMP Deino avec SMPAffinityChanger, carte de bouclage MS, un peu d'oc pour optimiser les scores. J'y ai passé deux jours et tout semble être rentré dans l'ordre...

 

Bravo DK pour le travail accompli, sans oublier les petites mains qui travaillent dans l'ombre...

Ravi que la Chti ait retrouvé des anges, elle va mieux pouvoir défendre sa place sur le podium (il n'est jamais trop tard).

Bienvenue aux nouveaux ainsi qu'aux anciens que je n'ai pas encore eu l'occasion de saluer. Du coup, j'offre ma tournée : buvez avec modération (étant donné l'heure matinale), mais pas qu'une goutte non plus : n'hésitez pas à vous hydrater généreusement !

 

Excellent dimanche.

Modifié le 12 juillet 2009 par anthome_vedene

[Cobra]

Coucou Vedene, notre bonjour à Toucas et Papiausaur

Modifié le 12 juillet 2009 par Cobra

[anthome_vedene]

Je n'y manquerai pas : Atoucas arrive demain avec sa petite famille pour profiter du festival pendant 48 heures. Au fait, je m'étais dit, quand on avait parlé de la braderie de Lille, que le festival d'Avignon pourrait servir de répétition générale : si certain(e)s sont tenté(e)s...

 

 

Quant à Papiosaur, j'ai appris qu'il avait renvoyé une WU en tant qu'Anonymous ! Il n'a rien compris, moi non plus. Mais la prochaine devrait profiter à notre fabteam ! Et comme il met environ un mois à plier une WU à 905 points...

[Bull45]

.....

 

2653 qui suit se passe correctement (un peu moins rapide qu'avec le client pich mais bull a expliqué pourquoi et la différence n'est pas telle que seulement 2 cores soient reconnus - 2550 ppd

Tu trouve ton CPU très efficace tant mieux

Voici le bench d'un q9400 non OC donc 2.66Ghz avec DEINO

 

Project : 2653

Core : SMP Gromacs

Frames : 100

Credit : 1760

 

-- \\Q9400\Fah SMP\ --

 

Min. Time / Frame : 9mn 45s - 2599.38 ppd

 

Tu trouve toujours ton CPU de 3Ghz aussi efficace ?

 

Edit:

Puis ton screen n'apprend rien sauf que tu occupe pas tes core convenablement. Compares avec un SMPDeino qui tourne que sur deux core

Modifié le 12 juillet 2009 par Bull45

[korentin]

le screen, c'était pour répondre à la remarque de Cobra qui pensait que Windows ne reconnaissait peut être que 2 cores.

quant au bench, ça doit aussi dépendre du nombre de processus qui fonctionnent en même temps puisque, comme tu le soulignes, à 100% de cpu j'atteins bien un peu plus de 2900 ppd (ce qui correspond pour 3GHz aux 2600 du Q9400 à 2.6)

 

Bon allez, je remets le -deino mais je n'ai toujours pas compris les raisons de l'écart entre ppd et occupation CPU, je pensais que ce serait linéaire (50% de cpu=50% de ppd). c'est pourtant comme ça en O/C

[DKlâgOR]

12/07/2009

Pour la team aujourd'hui

JVR2RAD (j'ai vraiment rien de rien

à

dire)

(*)

Pui

s

qu'il faut bien trouver quelque cho

s

e,

s

elon JGP et

s

on me

s

s

age auto du 11 juillet

Changement au cla

s

s

ement de

s

é

quipe

s

chez

S

tanford : l'

é

quipe

Pande Lab

grimpe au 22

è

me rang du top 30.

 

(*) Juste un truc, quand même... Les stats ont l'air un peu déglinguées aujourd'hui, tout le monde aligne des contre-perf...

 

Sauf ELLE :

zeb		foldeur							 sam.	  ven.	 jeu.	  mer.	  mar.	 lun.		
3		[Zebulon.fr]_grosminet				8 888	 6 336	1 920	 1 920	 1 920	1 920
5		[Zebulon.fr]_DK	   				6 081	11 866	8 410	11 464	11 984	8 384

je commence à trouver ça louche...

 

Et bravo à Bull pour cette subtile tentative toute discrète : Bull vs OCM (R_34 : 40ème AF avec 2 Mpts, 20 000 ppd.... Insiste encore un peu ?)

 

 

Sinon, pour les pingouins, une news de FAH-Addict : Test préliminaire des performances du Noyau Linux 2.6.31(rc2) que je n'ai certainement pas lue ^^

 

Bonnes vacances à ceux qui ont le bonheur d'en avoir et bon week-end aux autres.

À ce soir pour l'hebdo !

Modifié le 12 juillet 2009 par DKlâgOR

[Bull45]

je pensais que ce serait linéaire (50% de cpu=50% de ppd).

Non c'est pas toujours linéaire regarde 2 SMPDeino donc le premier sur 4 core et le second sur 2 core là c'est un Q6600 non OC

 

-- i3 SMP Bull45 --

 

Min. Time / Frame : 10mn 39s - 2379.72 ppd

Avg. Time / Frame : 10mn 55s - 2321.59 ppd

Cur. Time / Frame : 18mn 30s - 1369.95 ppd

R3F. Time / Frame : 18mn 30s - 1369.95 ppd

Eff. Time / Frame : 21mn 15s - 1192.66 ppd

 

 

-- F:\Fah SMP\ --

 

Min. Time / Frame : 16mn 26s - 1542.23 ppd

Avg. Time / Frame : 17mn 04s - 1485.00 ppd

No Cur. Time / Frame

No R3F. Time / Frame

No Eff. Time / Frame

 

Surtout avec Fah pour windows, il faut pas toujours chercher a comprendre le fin du fin