Je suis allé au bout de tes deux liens, et ai importé les fichiers par copier/coller. Chaque ligne se termine par CRLF dans les deux cas ! Mais c'est peut-être dû à ma méthode de récupération (tu ne laisses d'ailleurs pas le choix, avec tes liens).
Ceci dit, la codification Stanford est surprenante ! En effet, en théorie, si tu fais seulement LF (line feed), le curseur doit se retrouver en même position sur la ligne suivante, et non pas en tête de ligne suivante, grâce à CR (carriage return). D'ailleurs, le CR seul ferait revenir en tête de la ligne courante, et du coup la suite du texte serait en surimpression sur le texte déjà saisi.
Ceci dit, j'imagine que tu as résolu la situation en remplaçant LF par CRLF dans le fichier Stanford...