En principe rien, sous 2000 il se présente comme ça :
[boot loader]
timeout=30
default=multi(0)disk(0)rdisk(0)partition(1)\WINNT
[operating systems]
multi(0)disk(0)rdisk(0)partition(1)\WINNT="Microsoft Windows 2000 Professionnel" /fastdetect
Si tu veux un multiboot tu crées une nouvelle ligne concernant 98 (partition (2) par exemple)
Le fichier boot.ini est à la racine de C:\