Folding : le topic

[facks]

Bonjour, DK & Nico, vu vos explicitations, je croix avoir compris a peu près ce que je voulais savoir.

Vu la lenteur de mes machines, et l'intervention de mes enfants ( il suffit de dire de ne pas toucher a tel ou tel chose, qu'il s'empressent de le faire ) sur leur machine, j'ai fait que 0 point . Demain il i auras a nouveau quelque points.

[Cobra]

ATTENTION ! Vous avez un virus... ne paniquez pas... heu... non

 

Ce post est simplement une sauvegarde de la Page d'accueil, en vue de son rajeunissement en cours, grâce à l'aimable et précieuse collaboration de notre amie DK

 

 

 

Participez à Folding@Home

 

 

Le projet Folding@Home

 

Folding@Home est un projet scientifique à caractère biomédical dont le but est d'étudier le processus de repliement des protéines en vue d'établir leur conformation finale.

Cette connaissance est extrêmement importante. Pourquoi ? "En tant qu'éléments structurels, les protéines sont le composant principal de nos os, de nos muscles, de nos cheveux, de notre peau et de nos vaisseaux sanguins. En tant qu'anticorps, elles reconnaissent les éléments intrus et permettent au système immunitaire de se débarrasser des indésirables." (Source Folding@Home de l'Université Stanford, en Californie).

On peut ainsi déduire qu'un disfonctionnement dans le repliement amène à ce qui n'a pas lieu d'être, c'est-à-dire à des anomalies, causes essentielles des maladies dramatiques que sont les maladies du cancer, d'Alzheimer, de Creutzfeld Jakob, de Parkinson... Et nous savons que ces maladies touchent de plus en plus de personnes. Il est donc devenu vital de résoudre rapidement le mystère du repliement des protéines, grâce à une cartographie extrêmement précise.

 

Vous voulez en savoir plus sur le rôle capital que jouent les protéines dans nos organismes, l'objectif et les enjeux du projet Folding@Home ?

Visitez le site officiel, ainsi que celui de l'Alliance francophone dont notre équipe fait partie.

 

 

De par sa vocation universelle, humanitaire et altruiste - les résultats des simulations sont mis gratuitement à disposition des chercheurs - le projet Folding@Home connaît un immense succès. A un tel point que l'extraordinaire réussite de son portage sur la Playstation 3 de Sony l'a fait entrer dans le livre Guiness des records, en tant que réseau de calcul distribué le plus puissant de la planète.

 

Nous y sommes... calcul distribué... "distributed computing"... kézako ? Il consiste tout simplement à découper un calcul extrêmement complexe et long en des milliers d'unités et de sous-unités plus petites, et confier leur traitement à une multitude d'ordinateurs. Et là où cette technologie excelle, c'est qu'elle puise uniquement la puissance de calcul inutilisée des ordinateurs. L'utilisateur aura toujours la main car le logiciel client installé sur sa machine travaille en priorité basse. Et c'est ainsi que, dans ses travaux de tous les jours ou même avec des applications très gourmandes sur les machines plus modernes, il ne se rendra pratiquement pas compte du calcul effectué en arrière-plan, tout simplement parce que le traitement se mettra de façon dynamique au diapason des ressources restantes de l'ordinateur.

 

Folding@Home utilise donc la puissance disponible des ordinateurs sur lesquels ses logiciels clients ont été installés. Il prendra 100 % des ressources pendant que l'utilisateur ne se sert pas de son ordinateur, et, cas extrême, pratiquement 0 % si l'ordinateur est extrêmement sollicité.

 

Notre équipe

 

Afin d'attirer et de fidéliser les contributeurs, le staff de Folding@Home a mis en place un système de rétribution : chaque unité de travail rendue rapporte un certain nombre de points au contributeur. Et pour susciter et entretenir l'esprit de compétition, un classement est établi. Le classement est individuel mais il est également tenu à jour par équipes, elles-mêmes pouvant regrouper plusieurs mini-équipes.

 

Notre site informatique Zebulon.fr a sa propre mini-équipe. Tous ses membres se reconnaissent à leur pseudo commençant par [Zebulon.fr]_. Et notre mini-équipe fait partie de l'équipe 51 qui est celle de l'Alliance francophone. C'est pourquoi il est important de respecter les règles suivantes lors de la configuration du logiciel client que nous découvrirons plus loin :

Pseudo : [Zebulon.fr]_pseudo

Numéro d'équipe : 51

 

Cependant, si suivre l'évolution de son classement est motivant en soit, le but premier du contributeur est d'apporter son aide aux chercheurs soucieux de faire avancer la recherche médicale. C'est pourquoi toute contribution est utile, même la plus petite. Comme on dit : "les petits ruisseaux font les grandes rivières".

 

Téléchargement du client

 

Vous avez décidé d'apporter votre pierre à ce noble édifice qu'est le projet Folding@Home et vous vous demandez par où commencer.

C'est très simple, il suffit de télécharger et d'installer sur votre ordinateur un logiciel client fourni par Folding@Home. Une fois configuré, le logiciel récupérera automatiquement, via internet, une unité de travail brute sur les serveurs de l'université de Stanford que votre ordinateur traitera puis rendra aux serveurs. Une nouvelle unité vous sera également automatiquement téléchargée pour traitement, etc...

 

Les clients Folding@Home sont disponibles sur la page de téléchargement du site officiel et sa suite.

 

Quel client choisir ?

 

Tout dépendra de la machine sur laquelle vous allez "plier" mais aussi, quant aux ordinateurs, du système d'exploitation utilisé.

La page de téléchargement fournit les clients classés par systèmes d'exploitation, en tenant compte du type de machine.

Cependant, un complément d'information est nécessaire pour bien choisir son client et bien démarrer.

 

Voici nos recommandations :

 

- Clients pour CPU

 

- Vous avez un ordinateur avec un processeur mono-core sous Windows NT/2000/XP/Vista : client 5.04 text-only console

C'est le client CPU classique qui a fait ses preuves, avec des options intéressantes, et qui convient aussi bien à un "débutant" qu'à un plieur chevronné.

La "deadline" (délai de traitement) est très longue, ce qui fait que ce client est parfait pour ceux qui ne gardent pas allumé leur ordinateur 24h/24h et pour les possesseurs d'un ordinateur portable.

 

- Votre ordinateur avec un processeur mono-core fonctionne sous Windows XP/2003/Vista : client 6.23 console only

Ce client classique version 6 succède au client 5.04 et est une entrée en matière pour le futur client V6 unifié.

 

- Votre ordinateur est plus récent, avec un processeur multi-core, sous Windows 2003/XP/Vista : client 6.23 beta SMP console

 

- Vous avez un ordinateur avec un processeur mono-core sous Linux 32bits : client 6.02

 

- Vous avez un ordinateur sous Linux 64 bits : client 6.24beta

 

- Clients pour cartes graphiques (GPU)

 

- Vous avez une carte graphique ATI des séries 2xxx, 3xxx, 4xxx sous Windows XP/2003/Vista : GPU 6.23

 

- Vous avez une carte graphique NVidia à partir de la série 8, sous Windows XP/2003/Vista : GPU 6.23

 

- Client PS3

 

- Vous êtes l'heureux possesseur de la console phare de Sony, la PS3 : C'est le programme Folding@Home natif qui se charge du téléchargement

 

Les tutoriels pour l'installation des clients

 

CPU - Client 5.04 text-only console pour Windows NT/2000/XP/Vista - lancement d'une seule console / lancement de deux consoles

 

CPU - Client 6.23 console only pour Windows XP/2003/Vista

 

CPU - SMP client console 6.23 beta Deino MPI (32 bit only) pour Windows XP/2003/Vista

 

CPU - SMP client console 6.23 beta MPICH (32 bit or 64 bit) pour Windows XP/2003/Vista

 

CPU - Client unifié Linux 6.02 pour mode Uniprocesseur et mode SMP (fonctionne sur Linux 32 bits et 64 bits)

 

CPU - Client unifié Linux 6.24beta pour mode Uniprocesseur et mode SMP (fonctionne uniquement sur Linux 64 bits)

 

GPU console 6.23 client pour cartes graphiques ATI et NVidia sous Windows XP/2003/Vista

 

GPU System tray 6.23 client (installer msi) pour cartes graphiques ATI et NVidia sous Windows XP/2003/Vista

 

La PlayStation 3 de Sony

 

Les tutoriels pour résoudre certains problèmes

 

Qfix permet d'informer Stanford qu'une unité de travail est probablement défectueuse et donc de la retirer du circuit, tout en vous servant un peu de points.

 

La Carte de bouclage Microsoft simule une connexion réseau permanente et de ce fait empêche les clients SMP d'arrêter le calcul en cas d'une déconnexion réseau réelle.

 

Quelques liens utiles ou intéressants

 

- Une autre approche de folding@home et des explications et tutos mis à jour régulièrement : http://www.siteduzero.com/tutoriel-3-35582...lding-home.html

 

- Les paramètres à mettre dans la cible d'un raccourci : http://folding.mesdiscussions.net/foldingh...sujet_666_1.htm

 

- La surveillance de vos pliages : vous voulez connaître l'avancement des calculs, la date de fin estimée, le nombre de points apportés et bien d'autres infos, nous vous conseillons l'usage de FahMon. Compatible Linux, Windows et OSX il supporte plusieurs clients sur une machine et vous permet même de surveiller tous les clients de votre réseau.

 

- Le classement des participants actifs de l'équipe Zebulon.fr : http://folding.fleucorp.net/Zebulon.htm

 

- La liste des plieurs de l'équipe [Zebulon.fr] actifs en 2008 : http://forum.zebulon.fr/index.php?s=&s...t&p=1343994

 

- Le classement général des équipes de l'Alliance Francophone : http://folding.fleucorp.net/miniteam.htm

 

- Le classement général des membres de l'Alliance Francophone : http://folding.fleucorp.net/Alliance.htm

 

- Le Top 20 Producers de l'Alliance Francophone : http://folding.extremeoverclocking.com/tea...php?s=&t=51

 

- Les statistiques de KakaoStats : http://kakaostats.com/t.php?col=2&t=51...p;filter=active

 

- Le classement mondial pour l'ensemble du projet Folding@Home : http://folding.stanford.edu/English/Stats

 

- Et si vous voulez en apprendre davantage sur les protéines : http://forum.zebulon.fr/index.php?showtopi...p;#entry1168134

 

 

 

L'équipe de folding@home de Zebulon.fr

Modifié le 5 avril 2009 par Cobra

[DKlâgOR]

Je me demande, à propos de virus...

Regarde mon panneau de mp, depuis que tu as dis que le service te filait des boutons

 

 

 

Ta 2ème citation du jour, je peux la mettre dans ma signature ?

Contacté à l'instant, Descartes vient de donner son accord.

Dis, tu as vraiment relancé une campagne de recrutement ?

[anthome_vedene]

Félicitations à Grosminet pour ses 10 millions :P

 

Félicitations aussi à tous les plieurs, même s'il disparaissent parfois du tableau : leur contribution, qui peut paraître modeste en comparaison, n'est pas inutile.

 

Bravo encore à l'ensemble des participants à ce forum :non seulement ceux qui répondent aux questions mais aussi ceux qui en posent . Petit coup de chapeau en passant à Nicolas pour l'attention qu'il porte à l'ensemble de l'équipe .

 

Mille mercis enfin à Cobra (notre maître à tous) et à DK pour le travail accompli (et à venir) :P

 

J'en viens, Cobra, à la page d'accueil : puisque tu parles de mise à jour, je n'ai pas trouvé le client 5.04 sur le site de Stanford, et je n'ai pas trouvé mention du client 6.23 system tray dans ton topo. Ferais-tu un blocage, ou ai-je besoin de changer de lunettes ?

 

Bonne journée à toutes et à tous.

[DKlâgOR]

Le client 5.04 est dispo en page 3 des download : http://folding.stanford.edu/English/DownloadOld

Quant au client 6.23 system tray : moi aussi, j'attends le tuto de Cobra-notre-maître-à-tous pour tester le machin...

[BOBPILOU]

Dis, tu as vraiment relancé une campagne de recrutement ?

 

Oui et non juste pour les week-ends... Et mes points aujourd'hui c'est aussi un décalage d'envois cause prob connexion, hier JGP m'a mis des épluchures de cacahuètes du coup

[Cobra]

Le lien du client 5.04 se trouve dans le tuto et j'ai fait le client GPU system tray et j'avais précisé que le 6.23 cpu system tray était identique mais y a pas de problème pour le faire aussi

 

La nouvelle Page d'accueil est déjà affichée mais toujours en cure... heu... cours de rajeunissement...

[anthome_vedene]

Autant pour moi ! (one more time...). Ne vaudrait-il pas mieux supprimer :

"Les clients Folding@Home sont disponibles sur la page de téléchargement du site officiel et sa suite"

mais insérer les liens de téléchargement dans chaque tuto, du style :

 

"Téléchargez le client 5.04 ici"

 

ce qui pourrait faciliter le travail des non-spécialistes de l'informatique, a fortiori non anglophones !

J'ai bien conscience que cela représenterait du boulot supplémentaire pour Cobra... Mais si je peux aider...

 

Ce qui me donne l'occasion de reparler de ce que j'avais proposé, à savoir rédiger un message et un article à destination des anciens plieurs. Je n'ai pas oublié, et... j'y pense ! Et je m'y mets ! Mais un problème m'est apparu : à qui envoyer le message si le pseudo chez Stanford n'est pas celui chez Zeb ? Comment savoir que Bobpilou n'est autre que [Zebulon.fr]_grosminet ? Passe encore pour le _Rider et le _Biker ! (quoique...)

 

Pour le recrutement direct, je n'ai pas chômé, patientez encore un petit peu...

Modifié le 5 avril 2009 par anthome_vedene

[DKlâgOR]

Ne vaudrait-il pas mieux supprimer :

"Les clients Folding@Home sont disponibles sur la page de téléchargement du site officiel et sa suite"

Supprimer ?

À débattre...

 

mais insérer les liens de téléchargement dans chaque tuto, du style :

"Téléchargez le client 5.04 ici"

C'est prévu... et même mieux ! Mais faut laisser le Serpent souffler un peu si on ne veut pas lui voir affiché demain un score totalement anémique...

 

 

mp à Cobra : RAS, tout est parfait !

Modifié le 5 avril 2009 par DKlâgOR

[Cobra]

J'ai corrigé ce que tu as dit miss

 

Concernant la suppression des liens de téléchargement dans la Page d'accueil, je serais plutôt d'accord car le lien est plus explicite dans le tuto et comme on a dit, tous les deux, je mettrai une petite capture d'écran de l'intitulé précis du client avec le logo win ou lin, ainsi il ne pourra pas y avoir d'erreur dans la sélection du client à télécharger. Et ça évitera surtout le nouveau à aller directement sur n'importe quelle page de download et télécharger n'importe quoi

 

Pour la compréhension générale, nous avons gardé "Les recommandations..." avec les clients console ...et une liste des "Tutoriels..." qui inclut également d'autres modes dont le system tray, etc...

 

Le nouveau suivrait donc nos "recommandations" mais lorsqu'il sera aguerri et aura fait sa propre expérience, comme la plupart d'entre nous , il sera libre de son propre choix.